聚光灯采访Andrew Calabrese博士–Agrimetis的化学副总副副委员会

2016年9月6日

“从工业研究中的学术研究,批量数据推动工业研究的实现,无论是药物还是农用化学品。在Academia,您可能会在一个非常具体的问题上专注于一个非常具体的问题,并且非常仔细地跟踪数据。在工业中’s所有关于批量数据,以及它 ’关于多种化合物的绘制图与多个数据点的绘制图,并尝试找到相关性并找到异常值并找出化合物正在做的原因’在做。 CDD Vault是批量数据分析的一个很好的工具。“


Dr. Andrew Calabrese -Agrimetis的化学副总副副委员会

安德鲁卡拉布里斯
Agrimetis的化学副总副副委员会

安德鲁卡拉布里斯于2014年加入Agrimetis,在其形成之上。自2002年以来,他在广泛的治疗领域致力于辉瑞公司和锡格尼的各种项目和管理角色。他曾致力于和LED项目,将9个小分子新颖的化学实体(NCE)交付给临床开发,其中一阶段将在2阶段。他在伦敦大学学院的天然产物综合的化学中获得了博士学位,继他在牛津大学化学的本科学习之后。他的博士后工作是桦木还原对杂环化合物的新应用。


受访者采访了 惠特尼史密斯,合作药物发现,Inc。

今天’S Spotlight采访是Andrew Calabrese博士,在Agrimetis,LLC的化学VP。  Agrimetis. 是CDD的客户,这是一个不同的个人资料,然后是我们的许多生物技术和学术伙伴,在这一agrimetis中专注于开发创新的作物保护产品。令人着迷的科学和信息学需要,对药物发现的人来说,我们认为与安德鲁的采访对我们始终不断增长的CDD社区感兴趣。安德鲁,谢谢你今天加入我们。

安德鲁卡拉布里斯:它’很高兴在这里。

 

你能告诉我们公司的背景吗?

AC:Agrimetis成立于21/2年以前2年前,作为两家公司之间的合资企业。一家公司是一家位于巴尔的摩的种子创新公司 acidophil.。合资企业的另一家公司是 Syngenta Ventures.,位于北卡罗来纳州罗利。成立Agrimetis是为了采取某些在嗜酸蹄虫中发现的技术,并将其应用于作物保护 - 寻找可供农民在该领域使用的药剂的新方法,以增加产量,保护他们的作物免受那些害虫的各种害虫保护其庄稼。

 

是什么’s your background?

AC:I.’通过训练M有机化学家。我在U.K的牛津大学获得了我的本科学位。然后,在伦敦大学的天然产品综合培养了博士学位 [与Karl Hale教授],在牛津大学结束之前 [与Tim Donohoe] 做一个医生。在此期间,我被招募到英国的辉瑞公司。我在那里工作了大约6年的各种角色,开始作为长凳化学家,并进入化学领导和最终项目领导力。在网站上稍微关闭在U.K.之前,我将在圣地亚哥的Celgene转移到他们的化学管理团队中,在那里我在那里的5年左右有各种不同的角色。然后,大约2 1/2年前,我在巴尔的摩马里兰州加入嗜酸嗜酸嗜酸嗜酸嗜酸嗜酸辛博利了。

 

什么’S Agrimetis的最终目标’工作,两者在短期内,长期更加大胆?

AC:Agrimetis正在努力确定它可以进入现场试验的化合物。与药品不同,您可以在您的生物学中跟踪一个主要终点,然后许多与药代动力学相关的附属端点,在作物保护中’重新寻找广泛的活动。它’s有点像抗感染者计划,你可能会遵循几种不同类型的真菌或害虫。因此,每个化合物都有多个数据点为此生成了多个数据点,最多......我认为我们目前正在运行大约一些更高级化合物的12个。因此,在短期内,到今年年底,我们希望找到一种能够进入现场试验的化合物,特别是杀虫剂。

 

自从你 ’VE具有如此广泛的经验,小生物技术,制药和作物保护之间的差异是什么,以及管理每种环境的过程中?在该环境下进行研究的要求是什么,以及您希望在每个组织中的每个阶段完成什么?

AC:大医药和大型生物技术公司往往非常相似。主要差异往往是数据的数量’为给定的化合物产生。较小的生物技术公司可以’t负担得起大量的辅助数据,因为它们没有自动化系统就位。因此,数据量较低,但数据的值要高得多。

 

你想更多地扩展你的工作吗?’与合作伙伴关系和CRO生态系统以及如何将这些产品一起使用?

AC:Agrimetis本质上是一种生成知识产权的虚拟公司。工作的人产生了将公司进入新型作物保护代理人的突破性想法。这项工作几乎完全外包。我们在马里兰州Gaithersburg有一个小实验室,有几个长凳做一点工作,但绝大多数科学都在外部完成。我们有各种其他较小的合同,我们’在美国和南半球的定制群体中放置,因为我们进入了现场试验,并且随着我们进入蜜蜂等东西的测试化合物,例如,我们可以利用不同半球的不同季节来尝试加速我们的计划。

 

我想跟进,通过关于找到Agrimetis的信息系统的旅程说话。您是否使用任何其他系统来管理Agrimetis的所有这些外部和内部数据,您是否正在寻找启动系统?

AC:当Agrimetis开始时,我们基本上使用了Excel电子表格,当时很好。当我们只有少数化合物时,使用Excel电子表格管理数据并管理运输相当简单。 Agrimetis现在高达600-700个化合物。在这种情况下,Excel电子表格将是不可能的。

我不得不承认,我们没有’看看太多了。在先前的公司,我已经对那里的工具进行了评估,而CDD Vault是我的推荐。所以我们继续购买产品。

 

什么 are the primary goals for bringing in CDD Vault at AgriMetis?

AC:那么我们’希望在这种使用形式中实现CDD Vault,是三件事。第一件事是它将是我们所有数据的存储库,它将是我们可以与CRO通信的方式并从中收集数据。其次,它将被使用,并正在使用它的方式中使用它的方式 - 数据挖掘,管道输出数据等。第三种使用我们可以在某种程度上设想,使用它作为尽职调查的资源合作。

 

在您的不同协作者之间的安全性或控制这些合作者所看到的能力之前,您提到了。这是您选择产品的重要组成部分吗?

AC:绝对。这是一个重要组成部分。我们有四个基本组成部分。首先,考虑到合作者,他们必须基于网络–特别是在海外的合作者。它’如果产品是基于Web的,则更容易。其次,必须有足够的安全修剪。第三,它必须是我们可以用作存储库的产品,而是作为安全存储库,其与安全修剪有点不同。安全存储库,更多的是沿线“we’重新将所有信息放在这里,我们希望它安全安全”。第四个标准是它必须由可靠的第三方举办– we didn’要在房子里放一个服务器,因为我们没有设置为此。 CDD Vault符合所有这些标准。

 

现在,您拥有CDD Vault,您可以超出您喜欢的两件或三件事。’ve already listed?

AC:当然,正如我所阐明的,因为我与数据生成的处理有点普通,就在CDD拱顶通常用于制药公司而言。每个化合物的数据量略高,而且数据的产生方式是百万分之一的活动而不是浓度梯度。和查理随意和他的团队已经非常响应,帮助我们以一种方式将数据放入CDD Vault,以便它是正确的和有利地显示的方式。一世’对其的客户服务元素印象非常深刻–你们在这方面非常有帮助。

在实际使用率方面,如果您查看登录统计信息,Agrimetis可能有资格作为灯光用户。我们没有’在第一年使用它。这不是产品的反思’更像是我认为我想到我想早点而不是以后的决定的事实。我没有’希望我们争先恐后地争抢。所以今年我们将更多地使用它,特别是对于尽职调查,那种东西。但到目前为止的可用性已经很好。客户服务非常出色。我们全部最新。

 

你觉得自己喜欢吗?’避免了一些普通陷阱’在其他组织中看到或听到的,因为早期采用这项技术?

AC:是的,究竟。

 

CDD可以做得更好的两种或三件事是什么?你有什么事’像我们一样戴上我们的路线图

AC:那’一个艰难的。我不’认为我有什么东西,因为我喜欢这个产品。这个对我有用。我真的没有任何我能想到的东西。

好吧,如果你想到任何东西可以自由地发送我们的方式。我们’重新努力改善产品。

 

在这次采访中是否有别的沟通?

AC:我希望遇到的要点是我们’red talls cdd拱顶,我们正在谈论一个IT系统,我们正在谈论坐在电脑登录的人的人,实际上是我们的互动’与CDD的人有优秀。非常乐于助人,非常敏感,不只是说“哦,这样做”,但却是非常教育。所以CDD的东西的人一边我排名非常高。

那’S梦幻般的反馈。非常感谢你


此博客由CDD Vault社区成员创作。 CDD Vault是一个托管的 药物发现信息学 安全地管理私人和外部生物和化学数据的平台。它提供核心功能,包括 化学注册, 结构活动关系, 化学库存, 和 电子实验室笔记本 capabilities!

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