CDD扩展了Gates Grant

2011年1月13日

账单& Melinda Gates Foundation 最近延期 您以前的CDD补贴是创建一个新的数据库,与发现更有效的药物的合作 结核病(TB. )应该促进。

在过去的两年里,CDD-TB数据库(CDD TB DB)综合了在全球各地分布的学术,非营利,政府和企业实验室的努力,以努力发现对这种致命疾病的新疗法加速。

由于该项目现在在第三年的支持之下,这是突出前两年的一些成就的好时机。 CDD有:

  • 确保最高科学家和研究人员的参与从58多个重点实验室专注于发现结核病药物,包括20多个不同的科学合作项目。 CDD TB DB已成为大多数这些组工作流程的一个组成部分,并允许您更好地了解您的数据,更有效地使用您的有限资源。
  • 促进了多个实验室之间的合作,需要安全交换实验和计算结核数据,以便您可以专门比较您的结果,避免重复并制定更好的未来研究优先事项。这些合作使先前通信努力与“虚拟制药组织”进行沟通。
  • 确保四大全球制药公司的参与支持TB药物开发,并促进他们之间的数据交流和学术和其他非营利性研究小组,都在开放和安全的私人渠道上。
  • 数字化超过30,000个独特的分子,超过300,000 TB的分析数据点,来自发布,专利和社区来源的MIC,IC50和/或TOX数据;在CDD-TB-DB内施加。并为每个人发布他们的免费视图和评估 CDD公众 [超链接],一个免费的服务,以获取整个研究界的益处CDD。
  • 使参与的研究组使用苛刻的数据分析策略,其执行它们将能够针对每组的需求量来定制。这些实施例包括通过计算方法识别潜在的目标机制,搜索潜在的化合物用于使用药镜模型进行测试,优先考虑的重点是理想的分子特性,包括ADME,实施复杂的统计分析以及提供先进的可视化功能。 。
  • 通过创造联系选择和进一步调查的研究方向,对所有飞行员新组的进展作出重大贡献。

一些最先进的CDD功能已经在此结核病社区中亮相。例如,TB实验室之一使用CDD软件来管理分布式项目的组合,类似于内部大型制药公司。 CDD现在为所有用户提供“项目”名称“项目”提供此功能。

CDD TB DB项目的参与者称赞其价值:

  • Tanya Parish,传染病研究所:“CDD远远超过一个数据档案。这是我们所有研究的工作,如果我们建立更多的合作,它将变得更加重要。”
  • 无传染病研究所约书亚奥德丁:“CDD是金坑!”
  • 乔尔友好,德克萨斯州&M: "CDD只是我们在TB药物研究计划中使用的最好的软件工具。"
  • 托德Gruber,NH:CDD允许“我能够做出快速决定哪些连接应该进一步检查......特别是在寻找新的脚手架中。CDD对处理大量数据的价值非常宝贵的价值。”

我们期待着将CDD TB DB项目延长三年,并继续支持B.&我们感恩的MGF。

在该项目的过程中,CDD已发布与TB,被忽视的疾病以及与制药员工相关的有关的论文。所有这些文件都可以根据CDD提供。

  1. Ekins S,Friendly JS,Choi I,Sarker M和Talcott C,计算数据库,途径和化学信息学用于结核病药物发现的趋势,微生物学趋势,2010年。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21129975
  2. Ekins S和Williams AJ,Meta分析的分子特性模式和抗疟疾公共记录的过滤“击中”和药物,Medchemcomm,1:325-330,2010。
    http://pubs.rsc.org/en/Content/ArticleLanding/2010/MD/C0MD00129E
  3. Ekins S,Kaneko T,Lipinski Ca,Bradford J,Dole K,Spector A,Gregory K,Blondeau D,Ernst S,Yang J,Goncharoff N,Hohman M和Bunin Ba,分析和击中过滤的大型化合物库筛查结核分枝杆菌,Mol Biosyst,6:2316-2324,1010。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20835433
  4. Rishi R. Gupta,Gifford,Em,Liston T,Waller Cl,Hohman M,Bunin Ba和Ekins S,使用开源计算工具来预测人类代谢稳定性和额外的Adme / Tox属性,药物元代谢,38:2083-2090 ,2010年。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20693417
  5. ekins s和威廉姆斯ej,当制药公司出版大型数据集:今天的丰富的财富或傻瓜金?,今天的药物光盘15; 812-815,2010。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20732447
  6. Ekins S,Gupta R,Giffe E,Bunin Ba,Waller Cl,化学空间:CheminFormatics的缺失碎片,Pharm Res,27:2035-2039,10010。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20683645
  7. Ekins S.和Williams AJ,致力于合作者:Pharmaceutical Research的众群,Pharm Res,27:393-395,10010。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20107873
  8. Ekins S,Bradford J,Dole K,Spector A,Gregory K,Blondeau D,Hohman M和Bunin BA,结核病药物发现的协作数据库和计算模型,Mol Biosyst,6:840-851,10010。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20567770
  9. Bingham A和Ekins在制药和生物技术行业中的竞争合作。今天的药物迪斯科舞厅。 14:1079-1081,2009。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19835979
  10. Hohman M,Gregory K,Chibale K,Smith PJ,Ekins S和Bunin B,新的基于Web的工具,结合了化学信息学,生物学和社交网络的药物发现,Discov Discov今天。 2009年3月14日(5-6):261-70。
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19231313

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