博士乔尔友好,umdnj

2012年6月12日

CDD聚光灯亮点

“如果您在鼠标模型中看到此活动,具有您开发和制造的有效成分并带来这些早期阶段的,这真是非常令人兴奋......我们在我们结构开发活动关系的程序中一直使用CDD Vault。了解一个小分子如何调节目标。我们可以在以图形上和数值追求这些变化,并了解该结构如何影响目标的抑制。这对我们来说简单地令人难以置信,随着可能性,与许多不同的员工分享信息我真的很喜欢。在无缝方式交换数据是非常重要的。然后仍然仍有巨大的公共数据存档在CDD库上。“

博士乔尔友好

乔尔友好是UMDNJ - 新泽西医学院的助理教授,在制药行业8年后的学术区和有机化学博士学位后6年。

采访Barry Bunin,Phd,Ceo,Carborative Discopdy,Inc。

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编辑访谈成绩单

巴里布恩
我以为我只是开始想象并谈论她以前和未来的研究。

乔尔友好
我是友好的,是umdnj - 新泽西医学院的助理教授,在药理学与生理学部,医学厅和新兴和重新再生病原体中心。

我在生物技术制药行业度过了10年。在我的博士促销之后,我被医学化学世界的工业角度拒绝。经过大约八年后,我被介绍给疟疾领土,并在德克萨斯州A&M的途中返回学术界,成为生物化学和生物物理学系,作为一位高级科学家。我用化学工具与疟疾寄生虫的基本生物学 - 疟原虫疟原虫 - 探索,然后也与结核病感染的病原体 - 结核分枝杆菌。这真的是我的学术工作的开始,就像使用化学方法就是如何了解如何在该病原体中药学验证的治疗方法中的目标,只能提高对该病原体生物学的根本理解。

巴里布恩
他们目前研究的最终目的地是什么,以及一些基金实现这一简短和长期的资金?

乔尔友好
我们尝试研究病原体如何适应主人的生活,然后了解宿主如何适应感染。最终目标是了解在目标水平和药理学上验证该目标的这些调整。

例如,人们可以尝试调查目标是否对感染是必不可少的,特别是在水平 体内模型感染例如,在鼠标模型中。验证这些目标是非常重要的,然后递送将在德鲁格德的药物定义中的分子。这是与制药公司合作的先决条件,这是其在我们开发的分子中优化其医学化学的重要组成部分,并试图在工业规模中推动真正的药物开发。

巴里布恩
为什么和你如何使用CDD?

乔尔友好
我们与CDD的关系已经存在至少五年,我会说。当他们发给我时,多年前,巴里,一封电子邮件来看看软件,我真的很兴奋。它只是以简单的方式捕获结构数据的绝佳方式。我们所有时间都使用CDD进行我们开发结构活动关系的程序,以了解一个小分子如何调节目标。我们可以以图形方式和数值追求这些变化,并了解该结构如何影响目标的抑制。这对我们来说非常有价值,并且可以与我真正特权分享许多不同员工的信息。在无缝方式交换数据是非常重要的。然后仍然仍然在CDD上存档的巨大公共数据。这是非常有价值的,记录 SRIS. 拥有 反对TB. 在整个细胞方法中 截面为了轻松地浏览这些结构来查询子结构,看看您可以看到这些分子的样子。我知道CDD是数据交换的一个很大的支持者,这对社区来说是非常有价值的。如果我们希望使用每个人都在为这些疾病的途径推动,忽视疾病的忽视疾病的面积将尽可能有效地分享数据,这是至关重要的。

巴里布恩
你提到了合作。您如何共同努力,在内部您属于您所属的群体以及外部,与其他团体?只是谈论你的一些合作有什么工作,并在将来可以更好地思考什么?

乔尔友好
我认为与同样的合作非常重要,其中每一个有价值的贡献都知道每个团队成员都这样做。我真的不得不赞美TB和疟疾地区的任何人,因为我相信他们真的学会了合作的重要性以及最终产品的贡献程度是多么重要。你不能独自做所有的医学问题,这些医学问题巨大意义,合作简单地推动了更快的事情。

巴里布恩
他们在许多领域工作和发表,他们已经建议有点,但我只是想在CDD如何对TB研究中有用或有用的方面进行更多的深入,但是另一个地区,这样。例如,在他们是专家的两个不同区域附近的药物重新定位。

乔尔友好
CDD提供巨大的 宝贵的资源 来自其他人的结构关系:有没有人制造这个分子并对TB进行测试,这很重要了解。您可以浏览文献,我们今天拥有的其他工具比十或20年前更强大,但CDD在TB地区非常全面,就数据归档而言,因此它非常有价值的。

在重用的过程中,通过Sean Eykins,我已经发布之前,肖恩和他们当然在这个领域广泛发表。 CDD已经存档了许多这些数据,您只需绘制结构并按下一个按钮即可使用它。在这个阶段,我们不想重新发明轮子。我认为我们意识到小分子是工具。它们对自己有一个价值,但我认为它们与这些化学探针有关,希望能够进行治疗方法的细菌。因此,可以获得已知和批准的药物和测试数据真的很重要,以了解它们是否对相关疾病进行了测试,并了解实际数据的样子。在水平上,是否有真正的良好活动真的很重要,所以即使是批准的药物也可以以某种方式立即被重新淹没为反疟疾基金,这将是伟大的。否则,它们仍然具有作为化学探针的价值。这偏离了柯林斯和工人的定义,它将化学探针定义为非常非常具体的生物活性的东西。我建议,只要活动不混乱并且符合许多目标,我认为这种定义可能会扩展,但我认为Repur摆姿势也可以获得非常有价值的化学探针。

巴里布恩
你能谈谈别人的研究,他们认为他们认为有趣或显着,这是值得与他人分享的吗?

乔尔友好
最近考虑在我身上的工作来自 Eric Rubin,Chris Sassetti,Kyu Rhee和Dirk Schnappinger等 (Wei Jr,Krishnamoorthy V,Murphy K,Kim JH,Schnappinger D,Alber T,Sassetti Cm,Rhee Ky,Ruby EJ。抗生素目标的抑郁对增长产生了非常不同的影响。Proc Natl Acad Sci US A. 2011年3月8日; 108(10):4176-81。)这是一个很好的工作,因为它已经处理了目标易感性的非常有趣的话题。他们检查了你必须降低蛋白质水平以在整个细胞测试中看到生长缺陷的程度。它从埃里克·鲁宾和克里斯萨塞蒂劳动(PMID:11606763,PMID:12657046,PMID:14569030)以及比尔比亚和Gyanu Lamichhane(PMID:12775759,PMID:15784600)的工作,您预计您希望转座子的工作网站诱变检查以确定某些基因在某些情况下的TB 体外 或者 体内生长条件 是必不可少的。 Eric Rubin和其他人的工作是令人着迷的,鼓励对似乎最脆弱的目标的思考,并使我们能够在TB药物开发领域优先考虑我们的努力。我认为这是一个从根本上有趣的问题,这是促进这种易感性的因素,所以我欢迎这一出版物。

巴里布恩
你能谈谈你在行业的十年活动中做出的有趣结果或经验吗?

乔尔友好
我认为行业在满足困难的决定并找到尽可能及时和性价比的关键路径。他们提出有关哪些里程碑至关重要的问题,这些活动对于推动新的治疗至关重要,这是非常重要的,这是一个非常重要的,某种东西是,院士喜欢修复太长时间才能捕捉最喜欢的项目。人们也可以争辩说,有时候需要等待一段时间,但行业必须达到“Go-No-Go”决定,以便尽可能地和成本效益。

巴里布恩
您已指出翻盖,您的学术职业生涯中有趣的个人经验或“AHA”扭矩,其中结果对您特别有趣或令人兴奋?

乔尔友好
我会尽量不要背叛太多,这与出版物相关,但我认为如果你是 在体内活动中 在动物模型中看到活跃的成分,这非常非常令人兴奋。在结核病领域中总有很好的争论,以及通过实际的人类感染的感染小鼠模型 结核分枝杆菌 反映。同时,在小鼠模型和人类中显示有效性的活性成分之间存在非常好的相关性。我认为这是一个在一个领域实际效果和展示的效果的第一步 在体内活动中。如果您在鼠标模型中看到此活动,具有您开发和制造和制造和通过这些早期阶段的活跃成分,这非常非常令人兴奋。

巴里布恩
这是一个良好的结论。感谢您的时间,乔尔和一个精彩的CDD聚光灯。


此博客由CDD Vault社区的成员编写。 CDD Vault是一个托管的 药物发现信息学 安全地管理私人和外部生物和化学数据的平台。它提供核心功能 化学注册, 结构活动关系, 化学库存电子实验室笔记本功能!

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