埃里克春天 ,Ph.D.,Celtaxsys CSO

2012年8月30日

CDD聚光灯亮点

“It’只是惊人的科学如何进入波浪。其中一些与您所在的工具有关,但是当我开始发现科学时,特别是天生免疫系统–中性粒细胞,这是我现在居住的地方,所以它’对我来说很迷人’来了。嗜中性粒细胞被视为相当不成熟的哑细胞,因为我们称之为叫他们,终点差异化,这对它有很多影响。他们基本上无法’当细胞认为,他们只是预编程做某事然后死了。这真的已经转过身来到它的位置,即将到达我们已经想到了很长一段时间的细胞,过去20年作为原始的,实际上并不是那么’重复非常复杂的细胞。”

 埃里克春天

埃里克春天 博士是洛杉矶制药生物部的前高级总监和创始人,他领导了该公司的首字母。在此之前,他在加利福尼亚州帕洛阿尔托的Roche药物中表演了关节炎疗法。在加利福尼亚州南旧金山的Arris / Axys Pharmaceuticals,他是合作项目的联合领袖,导致默克 ’S期III药物候选人,Odanacati。 2007年,Springman博士被州长Edward Rendell委任给宾夕法尼亚州药物,装置& Cosmetics Board.

采用Barry Bunin,Ceo Collaborative Discovery,Inc。

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编辑访谈成绩单

巴里布恩
埃里克,自从我们在实验室一起工作以来,我以为我会从pc蛋蛋彩票平台app关于你职业生涯的个人问题作为真正的科学家。对你的每件作品有趣,很酷’多年来一直合作?

埃里克春天
我认为吸引科学家对科学的事情是每一天都不同,每个项目都不同。它’总是出现自我更新的工作。只是思考,在Arris早期开始(Arris Pharmaceuticals),我们有pc蛋蛋彩票平台app非常有趣的项目 半胱氨酸蛋白酶,我们与早期化合物有一些有趣的挑战。我们不打败’确保他们是如何表演的,这是pc蛋蛋彩票平台app重大突破,以弄清楚该系列中的某些化合物采取行动,因此我们可以帮助将化学家引导到正确的化学系列之后。这是pc蛋蛋彩票平台app非常成功的项目,肯定是 Compeopsin K.  然后随后用于该领域的其他半胱氨酸蛋白酶。所以,就是,我会说,这一天的pc蛋蛋彩票平台app更有趣的项目之一我工作。对此有很多有趣的挑战。我认为每次都是pc蛋蛋彩票平台app生物化学师和生物物理学家,与化学家密切合作,真正处于生物学和药物发现的化学界面,我真的很喜欢这一工作的方面。它’S喜欢转化生物学家和生物学家化学的生物学,并在两种情况下在中间的某个地方。但是,我总是有趣的是,看到人们在围栏两侧的人们和创造性的解决方案,以便人们提出来解决药物发现中出现的问题。我觉得现在不仅仅是你的’重新试图获得每个人的优化的领导候选者’真的在枪下,在似乎有时互斥的地区取得进展,就像效力和口头可用性一样,我刚才喜欢我的许多项目’ve致力于和那个方式’S结合在一起创造优化的化合物,甚至可以被视为毒品候选人。

巴里布恩
那’s excellent. Just moving from Arris forward in time and in bringing this relevant to CDD. At your last company you used another informatics vendor, and currently you’与CDD一起工作,所以问题是为什么CDD更好?

埃里克春天
实际上我猜我’M幸运的是,在生物数据库和电子笔记本的电子时代,在罗氏在洛杉矶(基因士药物), 一世’ve使用电子数据库,从一定相当复杂的东西回到90年代在阿里斯,然后搬到罗氏在那里,我会说,pc蛋蛋彩票平台app放在pc蛋蛋彩票平台app系统,因为它来自许多不同的公司。我认为我们已经到位了六种不同的数据库系统,并且定期使用的系统是真正的本土。所以它非常僵硬。如果您需要任何东西,如果您需要更改pc蛋蛋彩票平台app单位,则必须转到程序员。然后在洛卡斯开始作为计算药品设计公司,并以前沿的精神,我们完全伴随着 电子笔记本电脑 系统和电子数据库系统,我会说整体都非常成功。但是,我觉得多年来我所观察到的两件事就是这一天,我认为电子数据库在捕获化学数据时非常擅长,但在捕获生物数据时真的挑战。我觉得有些是因为你做生物学方式的可变性,而且我认为它’难以以电子格式捕捉一些类似药代动力学曲线的东西,因为我不’真的明白了。但是,在这里’在我从哪里出来的地方,在我的最后一份近十年中,我们使用了来自pc蛋蛋彩票平台app非常大的供应商的电子笔记本电脑和电子数据库系统。首先,这是非常昂贵的,这对于我目前的七个人公司会令人望而却步。其次,我们幸运的是,我们有人有专家的计算机程序员。否则,我们将不断回到供应商重新编程的东西,以满足我们的需求。所以,对我来说,虽然pc蛋蛋彩票平台app可行的解决方案,但是,在自己的商店里,为您想要做的任何事情都非常繁琐。这不是pc蛋蛋彩票平台app限制’在罗氏,你有程序员,或者你’甚至在洛卡斯遗址,我们有程序员可以处理它,但不是在一家小公司。吸引我到CDD基本上是什么’Spc蛋蛋彩票平台app非常灵活的,现成的,非常实惠的解决方案,解决了我们在我来的时候有一种伟大的需求 Celtaxsys. 。我们在Excel电子表格中有很多数据,它没有与它相关的结构,因此我们没有办法将结构和活动与此时相结合。

巴里布恩
伟大的。因此,您可以更详细地讨论易于定制和技术信息学方面,也许可以将其连接到您在Celtaxsys的研究的最终目标以及对您的方法有趣,而且不同的是,如果它成功,为什么这会很重要。因此,如果您愿意,从数据的细节和需要定制到更广泛的智力挑战。

埃里克春天
Celtaxsys. 开始作为pc蛋蛋彩票平台app看起来的平台发现公司 免疫细胞功能,如迁移。因此,我们已经在调制免疫细胞功能的各个方面有效的化合物上积累了一堆数据,但对于试图选择化合物或向前移动化合物的任何人来说,您需要能够将事物进行比较 - 头。所以通过Excel数据表看起来试图比较两种不同的化合物,您要么必须将其全部上传到您的头部,或者您必须提出某种系统来制定决策,我认为’是我们最重要的事情之一’在Celtaxsys的旁边只是选择了35个我们开始的领导,选择两个是最有前途的领导者。我们真的不能’在没有一些数据组织的情况下,现在已经进入了未来,我们希望优化这些领导,因此我们将产生更多的化学数据和更多的生化数据。当你前进时,决策树变得更加复杂。您必须考虑更多的参数。所以我认为真的是捕获和编目信息和搜索它的唯一有效方法,它真的通过数据库系统。再次用CDD团队发现的是它的’Spc蛋蛋彩票平台app非常灵活和灵活的组织,对我们拥有的数据的种类非常敏感,并且诚实我们的蜂窝数据是功能蜂窝屏幕。所以’S漂亮的复杂,大多数数据库都无法处理我们尝试以摘要格式传达的复杂性类型。

巴里布恩
绝对地!我认为也是基于网络的协作方面有点有点在您的工作环境中讨论。因为你在旧金山和亚特兰大之间旅行,如果我的记忆是对的,你可能有其他人’在公司或外部进行协作,所以只有在这个地理上分散的方式工作,只是你和他人之间的一些沟通......

埃里克春天
I’很高兴你带来了大谷仓。我有点传递在我的脑海里,但你就在那里。吸引我到CDD的事情之一是它支持pc蛋蛋彩票平台app我们可以拥有的多个虚拟组织。我们的人民从我们的旧金山办公室里,甚至在我们的亚特兰大办公室’在路上重新在线查找数据。另一件事是我们为我们的一些化学优化工作中使用顾问,因此灵活地让他们访问安全的在线数据库是真正的无价之无价,因为我们可以’让他们进来只是能够看待复合信息,我们不’T必须在CD上运送数据库。我们不’如果我们不在,请在周围有电子邮件’想要。所以我认为这是基于Web的CDD的格式非常大​​的价值。有很多公司在那里有几个人试图完成250人的业务部门的工作,所以我可以看到这在行业中是pc蛋蛋彩票平台app非常重要的需求。一世’m不知道我使用过的任何其他包都可以适用于这种用法。

巴里布恩
我想在分子细胞生物学或其他地区的实际技术方面谈谈创新。您发现有趣的一些新实践以及您认为会影响未来的新实践是什么?

埃里克春天
我在我的职业生涯中,我会叫药理学时代,公司将拥有一支化学家团队制作有趣的化合物,并将它们粘在动物中,看看他们所做的事情,或者他们正在寻找像血液这样的生理读数等物品压力变化。然后我们经历了非常多的目标重点药物发现,这一切都始于:“这里’是pc蛋蛋彩票平台app有趣的目标,让’S找到一种对它有所作为的化合物,然后我们’LL弄清楚它以后真正做的事情。“这是有趣的,但对我来说真的很有趣’s回到更多“让’首先通过功能筛选来解决生理学,然后我们现在拥有工具将药理学与目标联系起来。它’不是完成的交易。它’挑战,但再次,我认为功能筛查的结果变得更加有趣,因为它会回到我的酶学根源​​。你’始终从基于目标的角度来看,你’重新寻找一些过程中的速率限制步骤或干预的关键点,我想什么时候’在进行功能筛选中,您本质地找到了首先找到具有非常强烈效果的那些点。在基于目标的时代演变的第二次挑战,当我们扩展到组合化学和高通量筛选时,这是许多化合物并不是真正所有的药物。它们可能对目标有效,但它们仍然不可渗透。当你的时候’阅读更多的生物屏幕,您知道有一些内置方面。如果您的目标是骨内细胞,你就没有’除非您是细胞可渗透,否则读出读数。因此,我认为有更好的化合物的特色,显然我们作为pc蛋蛋彩票平台app行业,令人更聪明地令人更聪明地制作了如何制造至少具有较高可能被纳入生物系统的可能性。对我来说’仍然是其中pc蛋蛋彩票平台app伟大的边界是将临床前或非纯生物学连接到人类患者人口中真正发生的临床或非临床生物学,因此转化研究以及翻译研究的出现,以及我们’真的不在那里。我觉得’在我们可以改善药物发现的广阔地区,在预测我们的模型系统的情况下,我们的模型系统是更好的,这可以转化为人类治疗。从机械角度来看,我认为是pc蛋蛋彩票平台app我们的行业’vers更聪明。机制似乎比某种建模效果更好,所以在那里’有些人在那里承诺,但我认为人体是如此复杂’与狗,或猪,或一匹马,或者你,或者你的任何东西都不一样’看着,我们的模型系统可能更好。

巴里布恩
我喜欢,你将基于目标的完整色域覆盖与组织蛋白蛋白k项目到一些表型示例。是否有迷人的商业或科学的开发或研究,您认为对更广泛的研究界的人们感兴趣?

埃里克春天
就像一名免责声明一样,过去几周我花了这么多时间,只是挖掘我自己的地区并进入河&D开发计划我们现在正在进行,我必须真正给予某种想法,所以如果我们可以回到那个可能会在我的脑海里提示。你再次知道是一位科学家,我认为即使是最具疏远的偏远的事情似乎也很有趣。一世’说话,所以我可以考虑这个。

你知道,周围发生了什么,我们在pc蛋蛋彩票平台app区域里居住’s re-emergent, and I’ll用它作为我的例子。它’只是惊人的科学如何进入波浪。其中一些是与您所在的工具有关,但是当我开始发现科学时,特别是天生的免疫系统 - 中性粒细胞,这就是我现在居住的地方,所以它’对我来说很迷人’来了。中性粒细胞刚刚被视为相当不成熟的哑细胞,因为我们被称为他们,终止差异化,这对它有很多影响,他们基本上是可以的 ’当细胞认为,他们只是预编程做某事然后死了。这真的已经转过身来到它的位置,即将到达我们已经想到了很长一段时间的细胞,过去20年作为原始的,实际上并不是那么’重复非常复杂的细胞。一世’当我在我的研究生工作时,我们试图识别MMPS–  基质金属蛋白酶,我们正在寻找机制 基质金属蛋白酶的激活s,但他们没有’尚未测序。所以信息的信息非常有限。我们试图获得序列,我们在我们的实验室进行了讨论,讨论基本上是这样的:“你可以’t从a中获得任何mRNA 中性粒细胞 ,因为他们不’因为他们制作任何mRNA’re 终点差异化。“真正坚持在我的脑海里,因为现在我们非常不同。中性粒细胞可以真正适应那里的很多交通流量,我认为这是pc蛋蛋彩票平台app新兴区域,就像我们一样’ve seen with the 巨噬细胞m1,m2故事。我想我们要找到,我们正在发现,在疾病状态或本地化中解析的中性粒细胞子集,其中一部分与我们使用诸如此类的工具更准确地研究它们的能力 单细胞成像流式细胞术,这让您对单个细胞的各种功能方面提供了pc蛋蛋彩票平台app非常深入的洞察力。所以对我来说这是pc蛋蛋彩票平台app非常有趣的觉醒,对一般观众来说可能是有趣的,我不’真的知道。我活着,所以它’对我而言。但是,我们认为这么长时间的这些细胞基本上是免疫系统的一种典当,现在实际上是围绕着皇室的更多部分。

我可以帮你回来第二次巴里吗?

巴里布恩
绝对地。我喜欢它,你’现在把我当场。

埃里克春天
这是有趣的谈话,因为我认为你的整个合作名称很有趣,因为它似乎在某种程度上,我们似乎是我们在工业中进行协作的方式。通常有合作的障碍。我知道我们与我们在公司内的同行合作,我们与学术界在学术界中的选择同行合作,但我们不’T通常在公司之间合作,虽然它’现在有点不同,因为小公司喜欢Celtaxsys,我们喜欢找到我们可以与之合作的正交各种能力的其他公司。但一般来说,我认为合作药物发现的想法真的很迷人,而且我只是想知道,什么’您对科学家的地位有助于毒品发现:什么’是它的地位,你认为它实际上可以去哪里?

巴里布恩
那’是pc蛋蛋彩票平台app很好的问题,我认为它在理论上最大程度地是什么,然后是什么’鉴于知识产权要求的现实,实际情况。从该分析的答案是技术上,各公司或其他共同组合在一起的巨大协同作用,您需要与每组的各个组织协调’对自己的商业挑战需求,但我认为它’非常可达。所以pc蛋蛋彩票平台app示例来自盖茨基金会,最近有一些 新闻发布关于此,他们正在使用七大药和一些结核病筛查实验室 在合作中 项目 。所以你可以想象有那些挑战和机会。另pc蛋蛋彩票平台app引用是一种相关的,是来自 德勒费舍尔·朱尔维森 在谈话中,他们提到他们’重新资助各种不同的公司以及他们发现的是存在具有很大的技术协同效应的情况,即使这些公司都有自己的冒险挑战。所以恩典和优雅在于我们认为是任何事情的合作。它可以在两个人在走廊或两个完全不同的组织之间的两个人之间合作。但是我们是什么’一直在弄清楚的是,当人们对能够进行更多的控制能够分区数据时,将其分开和安全,并决定何时和谁分享,实际上我们促进了矛盾的矛盾。并且原因是即使在私人库中捕获的信息,例如pc蛋蛋彩票平台app人,例如在与其他人分享之前寻找QC他们自己的数据的人,有一定的激活障碍。然后有pc蛋蛋彩票平台app第二个,这是每个人都有斗争,是如何决定我与谁与之分享或合作。实际上,激活屏障不一定比捕获的更高 ’是最有趣的信息,是您自己的实验或其他人’S,未发表或发布。所以我认为我们只是在海滩头部的开始,以及如何让人们如何与可能产生积极影响的任何人合作的最大自由。我想我们’在那里开始解决那里的良好工作,然后从这将遵循社会问题和合同问题,但我认为有些例子是你知道的’水下坡的水。pc蛋蛋彩票平台app例子,我会引用,NIH有pc蛋蛋彩票平台app行业 nih圆桌会议 药物重新定位和重新估算,您可以使用阶段2阶段的安全和有效的东西,但也许不会被制定出于商业原因或其他原因,但它可能是pc蛋蛋彩票平台app罕见被忽视疾病的有用候选者。所以现在 ncats. TRND. 程序,有许多项目正在寻找进入该组协同作用。所以我认为解决方案将是它’没有一夜之间会发生的,但我认为解决方案是让每个人都在他们想要分享数据的时候,他们想要分享数据以及如何轻轻地鼓励更多的合作,同时让人们有控制。我觉得’是你可以拥有的最大效率,回到我在开始时所说的,将理论与何处配对’逼真的地方。以便’我们专注于什么,然后发生这种情况需要各种软件工具,需要各种各样的流程和内容,鼓励我们获得我们在药物发现过程之外看到的效率。它’很有意思,因为在我们的行业中,您需要合作,并且您需要能够拥有一些可以获得溢价的知识产权的东西,所以’挑战和那个挑战’有机会。我希望能回答你的问题。

埃里克春天
是的,它确实如此。

巴里布恩
那也许那个’很好的票据结束它。除非还有其他东西。我特别感谢您面试。它’总是有趣和你说话。


此博客由CDD Vault社区成员创作。 CDD Vault是pc蛋蛋彩票平台app托管的 药物发现信息学 安全地管理私人和外部生物和化学数据的平台。它提供核心功能,包括 化学注册, 结构活动关系, 化学库存 , 和 电子实验室笔记本 capabilities!

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