巴里布恩 - Transcription de L'Entretien du Groupe de Travail Sur LeRejositiondsdesmédicaments

20 Juillet 2011.

巴里布恩

巴里

好的,所以我要谈谈协作平台来推动药物重新淘汰,这也是一种用于药物发现是否重新展示的平台,以及我们一直与账单合作的合作的一个例子 &Melinda Gates基金会一直在支持结核病研究,最近由NIH的Intramural和TB Alliance的研究人员提名,这是为了这个生物的最佳实践奖,这是一个有趣的是,我们支持全球合作的结核病研究人员它与一些带有三个不同大型药物的领先的TB研究人员进入了第二阶段,以推进那些结核病项目,因此这将是我谈论的三种案例研究之一。

所以简单地跨越主要技术的概念,它被称为 CDD保险库®在发布或专利之前强调IP敏感数据的隐私和安全性。首先强调安全性绝对是重要的,因为握手代表的协作能力,使您可以选择性地与生物数据或生物数据选择性地共享化学结构,而不将化学结构降至单独的实验(即一个分子或IC50测量) 。因此,对于毒品重估的东西,在您想要不同的大脑和不同的假设和预测甚至不同群体的不同假设和预测甚至实验验证,即使他们是不同的公司,人们也只有一个组织的方式。因此,CDD的广泛愿景是,任何人都可以与其他人一起使用,无论他们在工作中的哪个群体,我们一直在云中七年。 MM4TB协作 是一个有趣的例子,有两个大药店,Astrazeneca和Sanofi-Aventis,与大约30个不同的组织一起工作并工作 一个凝聚力组在拱顶中使用协作项目 (在某些情况下具有大药物遮蔽结构)。 GlaxoSmithkline在CDD和Novartis上共享Malaria数据和CDD上的结核病数据(两者都使用了安全的保险库,协作和公共功能)。例如,许多学者,筛选中心,在那里他们可以在那里进行不同的教授,其中具有不同克隆蛋白的不同克隆蛋白质与化学品供应商库。因此,筛选中心可以使用CDD库而不上传化学库20不同的时间,他们只是将其上传到Vault,每个生物学家都有一个独立的安全协作项目。如果您有权查看所有20个项目,您可以在所有数据上都可以挖掘所有数据,相反,如果其他人可以访问1个项目,他们只会看到数据访问该数据并没有关于其他19个项目存在的数据。我们已经制定了一种简单的方法,因此研究人员可以在他们的自然科学工作流程中进行合作。

传统技术的扭曲是协作能力,因此该图表的重点是从个人的角度来看,而是组织的需求以及暂时访问,例如,如果要仔细检查并确认在合作之前或者如果您想要类似于三个不同的实验室的空间分区,但它们应该只看到其三分之一,然后按照您早些时候键入对象是ki或一批处理。分子。所以这是我们一直在创新的地方。

那么这与可能有资产的组织如何与他们想要与其他学者或其他具有互补功能的公司重新灌注的组织相关?因此,如果您思考药物发现过程的经济学,大公司不会将每种药物一直带走,我们昨天有很多人听到的是在第二阶段之后有清洁安全或TOX简介的化合物。也许不够有效或没有足够的市场机会,以保证更昂贵的三期审判。

那么如何允许所有伟大的工作和潜在活动,可能是一个罕见或被忽视的甚至是另一个伴侣进一步采取的少数商业指示,以及如何从代表知识产权代表知识产权的数据方面弄清楚这些团体可以作为一个人一起工作吗?

所以有综述。这只是为了给出海报儿童的公共空间的一个例子,用于药物重新定位或修复沙利度德,其中有十个我们愿意在公共空间中分享的其他10个群体的数据。现在,对于公共空间中的每个示例,私人或协作空间中的数据将是20倍。因此,我们的同事之一Sean Eikins最近发表了关于重新定位批准和被忽视疾病的批准药物的审查。我认为有两个有趣的表格仅仅是分享,例如AK1,一个受体拮抗剂,被寻找用于抗毒性艾滋病毒感染和抗癌疾病,因此这些都被低吞吐量筛查方法发现了,并让人们有机会看看这是因为基于您的背景和您可能有其他想法的药物的背景和知识。

第二个好的桌子只是通过较高吞吐量或甚至发现的例子 客栈 siliico. 方法尤其是我想提到这款约翰霍普金斯集团我们正在使用,David Sullivan实际上有一个物理化合物图书馆,这些物理化合物在CDD中的结构,但实际的Microtitor Plates可用于电镀和运输成本他在自然纸上发表。 Brian Roth还早些时候发表了一篇论文的旧药物的新用途,所以这是一个已经有点是多年来势头的一个地区,与之前的幻灯片一样,而不是谈论每个例子,我将只是给人们一两个两个人思考这一点,并能够为他们提供适用于其他领域的药物资产的想法。如果人们想要更多信息,他们只需用电子邮件给我或肖恩发电子邮件,谁是纸上的实际作者。

因此,在该出版物中使用CDD用于药物重新定位的示例,可以使用诸如使用2D相似性搜索的TB筛选数据设置的一些数据。您可以在CDD中进行次结构和Tanimoto相似性,他可以自己做其他更复杂的药效线方法。您可以在公共部门中的数据集之间寻找匹配项,如FDA药物,然后是FDA药物 找到一种像你的命中一样的分子是一个已知的药物 所以一个项目,任何项目都不是药物重新定位,潜在地批准努力可能是!

这是因为在公共空间中(即使大多数数据在私人保险库和协作保险库中),我们已经从CDD中搜索了FDA站点子结构,这些信息他们对用于重新施用/重新定位的药物以及示例的信息比如我们所拥有的复合供应商或学术供应商,例如,来自北卡罗来纳和科罗拉多州的GPCR基因 - 家族宽的SAR数据或脂质数据,因此搜索者可以在您正在努力的常规观点之外思考。而这是一个独特的原因,现在我们已经这样做了七年,我们有很多牵引与生态系统的不同部分,我们有这个瑞士的位置“如果你愿意”我们要求没有IP,我们的整个信任是基于我们与他人合作的事实,他们可以推动它。我们将提供该技术。我们的商业模式是CDD为您的私人使用的订阅,然后免费提供公共空间。

因此,仅仅为了分享另外两种案例研究,而且该技术和互补团体一起工作和选择性地分享数据。所以骑着观察的共同陷阱,维拉帕米将逆转癌症治疗的抗性,疟疾研究人员也发现这是真的。我们昨天听到疟疾的疟疾问题之一就是那里有 抗氯喹 ...因此,如果您可以组合那样提供像维拉帕米的复合,您可以逆转开普敦大学的抵抗力和凯利·奇格尔教授发现,仲胺四个原子远离芳环的这种副结构也将逆转阻力。因为他在UCSF和McKErrow教授进行了博士后,他们愿意一起工作,他们愿意一起工作,我们发现了79场与子结构的比赛,联系他们并在人类红血中有测定的彼得史密斯细胞发现一种将逆转阻力的化合物,这是重要的,因为如果您了解合成,可以节省几个月或季度或多年的时间表。但是,来自Chris Lipinski的另一件事与我们的第一个数据集的已知药物及其治疗适应症,我们发现18种已知药物与这个子结构和MS Discovery Chred Excled,并且看到有两种几乎在组合使用时完全逆转阻力 - 超过七倍的阻力。所以可能需要数年或数十年的时间表。如果你是一个具有抗性疟疾形式的孩子,那可能是非常有趣的。所以我分享这一点,因为a)没有技术选择性地分享数据,但是b)在不连接不同资源的情况下,它也不会发生其他人刚刚没有可用的不同资源。

因此,在今天的现代场景中,这是我早些时候用Astra-Zeneca和Sanofi-Aventis与斯图尔特科尔州的榜样,这是这个项目的PI,而且这个小组正在共同努力一个带有不同项目的选择性共享的一个拱顶并共同合作,因此它是我看到未来的现场的地方。

因此,切换齿轮一点点,有很多信息可以帮助吸毒发现,这并不是那些甚至发布的专有问题,例如Abbott NMR警报和辉瑞棉绒警报,如挑选芳香硝基或硫磺化合物您可能希望意识到,最近我们非常自豪,我们与辉瑞公司共同发布,即开源模型和描述符相当于昂贵的商业模式,这开辟了药物之间的集体协同效应的可能性药物和初创企业和学者您可能想要档案化合物 对疱疹表示 或者对于人类肝脏微观组织稳定性而不分享专有结构,就像你匿名患者一样,你不希望任何方法来逆转工程师。因此,我们有两种匿名信息的方式。首先是基于结构的模型,因此您甚至不必共享结构,只需共享模型。此海报仅显示统计数据相当于顶级商业描述符和模型。这种数据集特别有趣,因为当Pufizer达到Parke Davis,Pharmacy Upjohn,ET Cetera时,它们至少是我的知识,Adme和Tox数据集的最大集合,因此这些预测与数据一样好或糟糕设置它们是基于的,这些数据集是最强大的,如果不是世界上最强大的话。

因此,获得商业组织的第二部分完全舒适是选择性共享能力,因此这可以与一家公司一起使用,只需与其他公司一起使用,他们可能希望在许可药物重新定位候选人或其他毒品候选人中,但如果您将分子配置文件,看起来很有希望,这就是您希望在药物发现过程中进行下一个测定的地方。

所以只是为了总结,人们思考自己的个人努力,这项技术可以改变游戏和软件实际上确实影响了效率,以及我们所做的事情是这样做的,所以如果他们想要的话,人们可以在不必担心的情况下进行合作通过法律或业务发展周期等待六年或12个月,而是发现某些东西(通过同时协作),您可以更担心的是 - 所以这就是我想用它包装的地方。


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