化学和生物登记系统:他们是什么,你需要吗?

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什么是注册系统?

化学和生物记录系统可能是寻求精简工作流程的阿森纳实验室中有用的计算机工具。据姓名建议,录音系统旨在帮助跟踪用于实验的不同化学或生物实体,以及在实验室中创建的新闻作为知识产权。注册系统的基本函数是能够生成(或反映)识别每个实体和每个批次组合的明确标识符的能力。在其他特征中,这些系统可以进入有关复杂化学和生物分子的信息,包括它们的结构细节,各种物理和化学性质和测试数据。

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注册系统的好处

  1. 发现 - 实体注册的最重要原因可能是最明显的,可辨别。能够随时找到给定测试所需的内容节省时间,并且对研究人员的挫折不太沮丧。实验室可以随时有数百或数千分的分子和/或生物产品。这些包括试剂以及设计用于测试的实体,这构成了组织知识产权组合的重要组合。  
  2. 独特性 - 与化学或生物化合物合作的实验室的相关和同样重要的考虑是能够遵循与唯一性有关的实体(批次,盐等)的重要细节,并且是一种含糊不清或重复误差。录制系统可能会报告研究人员不自愿或筛选不同形式的相同实体的条目的案例。这些系统还可以区分具有相似结构,子结构或序列的实体。
  3. 跟着 - 使用注册系统将实体保存的另一个原因是他们将化学和生物实体存储化学和生物实体以进行进一步的随访。研究人员可以搜索实体并查看结构的所有细节,包括关于立体化学或类似序列的信息。
  4. 符合性 - 最后,实验室必须遵守国家和联邦政府的各种规定,良好的登记系统可以帮助避免在实验室的检查或审计期间出现惊喜。由于信息存在于一个集中位置,因此可以快速创建报告 - 考虑到所有存在的所有实体。
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化学和生物记录系统如何比较?

通常,可以记录的实体分为两类:1。化学分子和2.生物实体。一些注册系统专注于处理类别,而其他注册系统则针对两者设计。

化学记录: 包括用于进入各个化合物和组化合物的工具,通过结构搜索化合物,并将独特的标识分配给实验室中的每种化合物。这些系统包括用于建立和显示各种化合物和化合物家族之间的关系的特征,以及将化合物连接到筛选实验室中的数据。此外,化学系统是关于某些化学数据库的前进,即含量以存储分子而没有关于立体化学或相关的筛选数据的一些优质细节。 

生物注册: 提供一种功能,允许用户在生物实体上定义,记录,询问和报告,包括蛋白质,酶,抗体,DNA,RNA,细胞系,质粒,蛋白质,siRNA和蛋白质 - 药物缀合物。它还包括用于管理生物实体之间的关系的工具,收集关于个体实体的细节,例如蛋白质表达的信息,并在可能的情况下产生实体。

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记录系统特征

注册系统的一般好处包括:

  • 管理和监控并自动监测各种化学和生物实体以及化合物的混合物
  • 快速方便地要求定位兴趣实体
  • 将唯一标识符分配给生物分子和化合物
  • 减少在寻找化合物以及浪费的时间和资源上花费的时间和资源以测试相同化合物的未知形式
  • 可以从单个系统访问实验室实验中使用的不同实体的信息
  • 绘图和名称结构的组合功能,添加和查看注释,以及在单个系统中编辑结构
  • 大多数供应商可以透明地将其注册系统与现有的基础设施和实验室软件集成
  • 创建审计跟踪和报告的可能性

 

化学物质记录系统的具体优势包括: 

  • 使用结构数据文件或微笑通道注册分离的化合物或大量化合物的可能性
  • 标志是双重就业作为错误
  • 能够根据化合物的结构进入预期化学性质的信息
  • 在相同化合物的相关化合物和盐或同位素之间记录关系
  • 通过结构,子结构和替代结构搜索化合物
  • 记录和存储多组分化合物

 

生物记录系统的具体益处: 

  • 注册独特的生物实体或大量实体的可能性
  • 各种生物样品上的数据集合
  • 用于创建和共享复杂生物分子的工具
  • 执行序列相似性搜索的工具
  • 用于建立不同分子实体之间建立谱系的关系的工具,以及遵循谱系
  • 计算生物学特性的功能
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贸易登记系统

市场上有广泛的业务解决方案,具有实体注册功能。与许多商业解决方案一样,供应商可能包含在其功能和自定义功能中的自定义。在大多数情况下,这些系统可以很容易地集成到现有的实验室基础架构中,包括电子实验室日志和实验室信息管理系统等库存软件,甚至可以提供可以自动化某些数据管理流动的API,从而节省更多时间。

在市场上提供的解决方案中,我们可以提及

科学家使用显微镜
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为什么录音系统比电子表格更好?

电子表格有其实用程序。他们似乎是遵循你实验室的实体的可行选择。但它们是有限的,并且作为化合物和/或生物物质列表躺下,电子表格变得效效较低。此外,还没有通过思考化学家或生物学家来创造电子表格。它们没有能力正确绘制和显示化学结构或序列。 

这也意味着研究人员可能需要使用单独的解决方案来管理他们的搜索实体。例如,它们可以使用电子表格进行化学化合物的名称,然后使用单独的绘图工具来产生结构。这是一个可行的解决方案,但它增加了错误的风险,使其失去了宝贵的时间。另外,在Excel中,这些结构被记录为静态图像,可提供很少或没有的交互性。最后,如果可以编程制作各种化学计算的Excel函数,它需要工作和可能超过大多数实验室能力的专业知识。

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用林和榆树化学品和生物记录系统的比较

四肢 埃尔恩 是样品录制和监控系统。鉴于他们设计的目标,虽然主要在样品水平上,但具有与化学和生物注册系统类似的益处和特征。

四肢 和ELNS提供的功能范围可能包括用于样本,保存链,自定义报告功能,角色分配,任务管理,电子签名,供应管理,仪器维护,计费和客户计费的唯一标识符,以及更多。这些系统还提供了类似的优点,包括 

  • 轻松自动化的管理,消除了样品的管理和管理中的谜语并减少或消除了文书工作。 
  • 通过实验室流程和更高效和自动化工作流程实现的时间和金钱的成本可能导致所有领域的相当长的时间和金钱。 
  • 从单个系统访问的信息。 
  • 四肢 和ELN解决方案集成到现有的实验室基础设施中,包括测序仪器,光谱仪和PCR器件。 

差异是由于它们的特异性。如本文的开头所述,“注册系统的基本函数是能够生成(或反映)识别每个实体和每个批次组合的明确标识符的能力”。录制系统旨在不仅处理实体本身,还可以处理它们的结构,它们的序列和唯一录制号的生成,并将这些实体连接到任何相关的控制数据。 LIMS和ELNS,除非它们集成到记录系统中,否则通常不包括这种类型的功能。

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如何决定注册系统?

投资登记系统的决定是每个实验室必须单独采取的决定。如果您的实验室适用于大量的各种化合物和/或生物分子,或者与复合混合物配合使用,那么即可使用的现成系统(在网上理想地访问)通常是您对计算机组合的有趣投资。重要的是要注意一些实验室可以拥有建立自己的系统所需的专业知识或使用现有的开源选项。但是,这些选项具有一定的缺点,包括系统编程的专用责任,维护(通常代表随着时间的推移大部分时间),保证法规遵从性,更新和软件修复以及适当安全的实施。

对于正在考虑购买系统的实验室,这里有一些反思元素: 

  1. 您是否拥有购买系统和涵盖相关成本的预算 - 安装,许可证,员工培训,数据存储成本和连续维护?一些商业软件设施可以显着减少实验室的预算。因此,重要的是要确保强大的成本效益比(RCI)所需的计算。
  2. 登记系统是否可以符合现有的实验室基础设施?如今,大多数供应商都可以提供集成,但验证您购买的系统是否与您拥有的第三方基础架构一起使用或确定它需要的系统(手动,半自动或自动)。
  3. 卖方提出的升级有哪些能力,改进或定制升级?录制系统提供相同的基本功能,自定义功能可以有所不同。 
  4. 是否有机会直接与卖家参与?测试软件系统可能是有用的,以找到您的实验室的设计和功能的正确混合。评估是否免费或支付?
  5. 实施需要多长时间?任何软件的实现需要时间,并且注册系统相同。当您使用最近的基础设施进行现有基础架构时,重要的是要确定预期并建立计划,以确保实验室流程的严格中断。正在快速且简单或沉重地设置?
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结论

这既重要又可实现,具有良好的技术解决方案,能够快速学习数据并提高生产力。在所有部门中,化学和生物登记系统为具有大量化学和生物实体和相关数据的实验室提供了显着的附加值。作为更大的研究计算工具的一部分,这些解决方案可以提高运营效率,降低人为错误的风险,节省时间并保证您工作的完整性和继承。

参考

  1. 什么是化学记录? //info.selacapo.net/chemicalregistration
  2. 化学品数据库 //en.wikipedia.org/wiki/Chemical_database#List_of_Chemical_Registration_Systems
  3. CDD室的活动和录制模块 //www.selacapo.net/benefits/activity-registration/
  4. 生物芽生物记录表 //www.3dsbiovia.com/products/datasheets/biological-registration.pdf
  5. 化学品登记系统 http://openbabel.org/docs/current/Cheminf101/registration.html
  6. 良好的化学品库存系统的优点 //www.bioraft.com/resources/the-advantages-of-a-good-chemical-inventory-system
  7. 综合记录 http://www.corelims.com/v4Docs/Chemistry_Specific/Single_Compound_Registration/Chemistry_v4.htm
  8. 马丁,E.,Monge,A.,Dureet,J.A.,Gualandi,F.,Peitsch,C.,&Pospisisil先生,P。(2012)。建立R&D的化学注册系统CheminFormatics,4(1),11。 //doi.org/10.1186/1758-2946-4-11

此博客由CDD Vault社区的成员编写。 CDD Vault是一个平台 计算机科学 容纳 发现药物 安全地管理私人和外部生物和化学数据。它提供基本功能,包括 记录 化学品,这 结构 - 活动关系 , 这 化学库存 和能力的 电子实验室笔记本.

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