药物的合作发现赢得了SBIR Grant的第二阶段,以开发分布式私人数据集中的生物科工具,以改善药物发现

2013年11月19日

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Chinlingame - 2013年11月19日 - 2013年11月19日 - 互联网上的计算机发现电脑平台的供应商,宣布它已获得专注于计算模型和数据共享的软件开发项目的补助金。

国家推进科学中心的II阶段授予是能够分享生物数据的计划的一部分。

“在第一阶段,我们已经证明了结核机器学习模型可以在实验室之间共享并用于制作预测并选择要测试的化合物,”肖恩·艾基,博士,D .SC。,CDD。,CDD的科学主任。与Joel Freundlich(Rutgers - 新泽西医学院)合作,Robert Reynolds(南部研究所)和Allan Casey(传染病研究所),在体外整个细胞分枝杆菌结核病(1-5)中鉴定了新的活性化合物。 ekins先生补充说:“这项工作遵循2010年与辉瑞公司的宝贵合作,这也导致了一个文档,这些文件描述了用于Adme计算机模型的开源工具(6)的使用。然后,我们意识到”有一个重要的机会使用CDD托管并选择性地共享计算模型。“

授予将在CDD开发工作中构建在安全的选择性共享托管数据中,并将用于开发CDD的新产品。

所描述的项目是国家推进翻译科学中心的支持9亿九九42-02。内容只是作者的责任,并不一定代表国家推进翻译科学中心或国家卫生研究院的官方观点。

关于合作药物发现,Inc。
CDD.(www.collaborativedRug.com.)提供市场上最常用的计算机发现电脑平台。 CDDVault®是一个私人和安全的工业数据库,它将传统的计算机发现计算(注册和SAR)与社交网络功能相结合。可自由访问的CDD Vault版本允许研究人员从各种科学数据提供商中提取公共信息的独特聚合。

媒体联系方式:Barry Bunin,PHD,协同药物发现,(650)204-3084, [电子邮件 protected]

参考 :

1. Ekins S,Casey A.C,Roberts D,Parish T.和Bunin Ba,用于筛选和TB Mobile的贝叶斯模型,用于靶向结核分枝杆菌的特征,2013年提交。

2. Ekins S,Freundlich JS和Reynolds RC,融合了分枝杆菌的二元事件数据集,用于结核分枝杆菌机器学习模型及其评估,JCOBIM型号,在2013年。

3. Ekins S,Freundlich JS,Hobrath JV,White El,Reynolds RC,Membacterium Tuberculosis药物发现中的铅优化的计算方法,Pharm Res,2013年。

4. ekins s,reynolds rc,franzblau sg,wan b,freundlich js和bunin ba。使用经过验证的双事件贝叶斯模型,PLO一,8(5):E63240,2013,增强结核分枝杆菌药物发现中的点击鉴定。

5. Ekins S,Reynolds RC,Kim H,Koo M-S,Ekonomidis M,Talaube M,Paget SD,Woolhiser Lk Libeerts Aj,Bunin Ba,Connell N和Freundlich JS。贝叶斯模型利用药物发现的生物活性和细胞毒性信息,Chem Biol,20:370-378,2013。

Waller Cl,Liston T,Waller Cl,Hohman M,Bunin Bun Ba和Ekins S,使用开源计算工具来预测人类代谢稳定性和额外的ADME / TOX属性,药物元,38:2083 -2090,100,2010。