Ontolobridge-new平台连接用户和科学术语的开发人员

生物波动的本体存储库现在可用。

NCBI Bioportal上的Ontolobridge屏幕截图(链接,登录)。
Bioportal Ontolobridge的屏幕截图

Ontolobridge.生物波动该项目出版,该项目由斯坦福大学,迈阿密大学和协作药物发现之间的联合U01授予资助,管理科学词汇和管理本体创造者的一般用户旨在填补差距

本体描述科学术语与人类可读正式(逻辑)定义之间的关系。因此,本体学定义科学术语,并作为智能论文互相联系。在大数据的时代,可以搜索,访问,集成和重复使用数据集和其他数字研究对象,即数据到公平(可搜索,可访问,可互操作,可重复使用)正式词汇比以往更重要。

Ontolobridge是一种新技术,可实现更方便和半自动化的流程来使用新条件更新和扩展本体,同时接受社区的建议。

鼓励社区的投入和处理它是广泛传播本体论的重要特征。科学家不必选择较少的词汇或不恰当的词汇,或避免信令注释。 OntoloBridge允许研究人员直接连接到本体所有者,并要求从工作流程和整个科学界中受益的新术语。

初始用户的反应非常阳性。合作药物发现生物测定注释工具生物测定表达(www.bioassayexpress.com.Ontolobridge的集成,生物测定的整合被简化,可以提高生产率。用户可以推动一瞬间推出本体论,并且您可以在策展程序和本体专家之间开始反馈系统。

OntoloBridge目前提供生物测定本体(BaO),药物目标本体(DTO),蛋白质本体(PR),细胞系本体(CLO)和冠状病毒传染病本体(CIDO)。我们的团队正在努力扩展平台到达在线额外达到。如果您希望您的本体与Ontolobridge一起使用,[电子邮件 protected] 请联系我。 (如果要将您的本体添加到Bioportal,[电子邮件 protected] までご連絡ください)

关于hosuke.

U01补贴支持在NIH和授权组织之间联合研究的大量计划制定的发展。如Nihreporter所述,来自国家医学图书馆的U01LM012630支持这个项目。此内容是提交人的责任,并不一定代表国家推进翻译科学或国家卫生研究院的官方视图。细节是,//projectreporter.nih.gov/project_info_description.cfm?aid=9747967&icde=50608877

 

关于CDD.

CDD.(//www.selacapo.net/CDD.Vault®,主要产品),是最新的化学物质登记,测定数据管理和SAR分析的最新网站应用。 CDDVault®是一个主机类型数据库解决方案,用于安全管理和生物和化学数据的共享。它可以通过易于使用的Web界面直观地组织化学结构和生物研究数据并与内部或外部合作伙伴合作。 CDDVault®最近增长了它的技术,包括elns,型号和API功能。可以在我们的资源页面上查看58个CDD出版物/专利的全部列表://www.selacapo.net/pages/resources

请联系我们获取更多信息。

合作药物发现,(650)204-3084, [电子邮件 protected].com。

 

关于迈阿密大学护腕实验室

シューラー研究室は、マイアミ大学ミラー医学部の薬理学部(http://pharmacology.med.miami.edu/)とマイアミ大学のデータ科学・コンピューティング研究所(iDSC) (//ccs.miami.edu/focus-area/drug-discovery/)。囚犯组的主要研究主题是一种系统药物发现。我们整合和模型低分子量 - 蛋白质相互作用,系统生物学,整合化学数据,以及改善疾病模型转换为新的功能性小分子。大数据分析,生物keminomatic工具,使用生物kemoinformatics工具,我们建立了一种复杂的建模管道,可以理解和预测药物机制,混杂和多酚的机制。除了大型项目之外,一些集中的项目还在开发正式本体(生物分类,拖动目标本体等),数据标准和您将用于最终用户的多层软件应用程序。几种药物发现联合研究是从癌症到神经疾病的。

为了物理制作和测试最有前途的低分子量,我们开发了一种计算优化的合成途径,并使用并行合成技术来产生低分子量的复合文库。通过组合计算和化学方法,我们正在加速读取优化和临床化合物。

该集团是基于集成网络的蜂窝签名(LINCs)项目的库(http://bd2k-lincs.org/),知识(BD2K)程序的大数据(//datascience.nih.gov/bd2k),照亮可毒性基因组(IDG)项目(//druggablegenome.net/我们参加了三大国内财团)。最近,我们还参加了最近成立的NIH数据公共日子。

盗版出版物://goo.gl/TsNof9

联系StephanSchürer,博士,迈阿密大学,+ 1-305-243-6552, [电子邮件 protected]

 

关于斯坦福大学医学信息学研究中心

斯坦福斯坦福生物医学信息学研究中心(BMIR; http://bmir.stanford.edu/增强生物经理学学的高级计算方法的开发与评价。 BMIR是扩展数据注释和检索(CEDAR)中心的中心,提供模块化休息可访问软件,并加速科学元数据规范,集合和发布,并提高数据描述质量,数量和互操作性。来自Protégé(Protégé),BMIR由数百万革命性和词汇(BioPortal)使用的数百万研究人员和服务使用,BMIR用于数百万的研究人员和服务。

所有项目的出版物的参考//metrics.stanford.edu/people/mark-musen で提供されています。

媒体联系。 Mark Musen,MD,斯坦福大学博士,+ 1-650-725-3384, [电子邮件 protected]