当您使用Ppc蛋蛋彩票平台app而不是pc蛋蛋彩票平台app时,为什么生命改变

2019年11月21日
(最初发布2014年7月8日,更新是2019年11月21日)

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Mark Naphle博士从桌子上
Facile Therapeutics,Inc。的联合创始人兼首席执行官

 

CDD Vault的相当数量的订户是pc蛋蛋彩票平台app使用值,体外测定保存和分析剂量响应数据。 CDD Vault的自动计算扩展计算PCI50值现在我来支持pc蛋蛋彩票平台app用户Ppc蛋蛋彩票平台app.我想说服使用使用。

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什么是pc蛋蛋彩票平台app首先?

pc蛋蛋彩票平台app测量,药物表明可以抑制特定的生物过程50%的浓度。例如,如果化合物A可以抑制50%的配体以5nM浓度的浓度与特异性受体结合,则pc蛋蛋彩票平台app值为5nm。密切相关的概念是EC50值,这是诱导生物过程的药物滴度。

那么pic50是什么?它只是表示摩尔中pc蛋蛋彩票平台app值的负对数。敬请期待。

  • μmpc蛋蛋彩票平台app是10-m,pic50 = 6。
  • NM pc蛋蛋彩票平台app是10-m,pic50 = 9。
  • NM pc蛋蛋彩票平台app是10-8m,pic50 = 8。
  • 100 NM pc蛋蛋彩票平台app是10-7m是m,它是pic50 = 7.0。
  • NM pc蛋蛋彩票平台app为3×10-m,这也是10-

你能看到模式吗?你正在为毒品发现工作......我在高中击中毕业缸时使用pH值。在实验室工作时,该溶液的酸度为10μm(10-5m)[h+]你这么说了吗?当然没有这样的东西。你谈到了ph 5的解决方案。而且你没有试图回到我的脑海中...即,ph值7.5是30 nm [h+] 我没有试图将它转换为。这是因为你认为从pH的pH值观察时训练自己,并且水溶液的酸度是酸度的程度是对数函数的事实。实验中的pH值为1至2至3,10mm至20mm至30mm [h+]是不是。

对于pc蛋蛋彩票平台app值(或测试激动剂的EC50值),您应该以这种方式思考。由于酶或细胞的剂量依赖性的抑制(或激活)是对数现象(相对于化合物的浓度),最好是看到这样的数据。此外,看着一个主要的制药公司的纸张,您会注意到抑制通常作为Ppc蛋蛋彩票平台app而不是pc蛋蛋彩票平台app报告。

那么,应该是这样的,因为默克这样做了吗?不,为什么这是正确的方式让我们讨论Merck和GSK使用它的原因)。

剂量响应曲线

当克制剂量响应数据时,您正在响应测试化合物的浓度(最后摩尔值)(简化,简化它)。但是,仔细地查看正在执行曲线拟合的方程(4个参数逻辑函数,别名SIGMoid函数),它们计算出响应与化合物浓度相比对数 是。

山方程式

这里是化合物浓度x で測定した応答です。以上响应不抑制剂(最大近值增加),在下面当酶(或细胞)完全抑制时响应(或最小增量值)。而且当然,pc蛋蛋彩票平台app是拐点(上下中点),是唯一的价值。

换句话说,曲线拟合实际上是求解逻辑50而不是pc蛋蛋彩票平台app。如果您想从拟合中知道错误,则可以获得对称地括在pc蛋蛋彩票平台app的标准错误(SEM)。但是,如果Ppc蛋蛋彩票平台app值开始更改为pc蛋蛋彩票平台app,则错误是不对称的,并且没有意义。

为了获得pc蛋蛋彩票平台app,您必须是一条鱼的反日志。这很容易PC和Excel。所以“每个人都在做”。然而,通过踩到“简单的步骤”,它将遭受大量的损失。你有什么好处?生活如何变化?

为了开始你的手,让我们考虑数据演示和重要人物(参见重要数字,对吧?让我们考虑将pc蛋蛋彩票平台app从弱化合物呈现给强大的化合物。你的桌子可能如下。

IC50表

难以检查同一表中具有广泛功效的化合物的数据。大多数文本编辑器和文字处理器非常难以安排专注于小数点的数字(应该是为了让读取更容易)。此外,它是排列有效数字的一部分。这不是专业人士。

这里存在相同的数据,但表显示了Ppc蛋蛋彩票平台app值。

pic50_cdd_vault.

看看它,它太美了。它被安排而不花费约小数点的额外时间,并且有效数字的数量都是相同的。比任何事更重要,就是相对电力强度很好地理解。您在项目团队会议上呈现哪些?

接下来,让我们看看化合物I和J.线性pc蛋蛋彩票平台appS介于“两倍的效能”。但看看pic0s。差异是如此大......这是对的。因为pc蛋蛋彩票平台app是对数函数......应在对数差异中考虑差异。

在试图开始获得化合物的平均值时,实现了另一个重要的优点。平均pc蛋蛋彩票平台app值的适当方法是采用pc蛋蛋彩票平台app值的几何平均值,而不是算术平均值。请记住,n值的算术平均值是n值的总和除以n。相比之下,几何平均值是n值它可以通过确定和服用产品的n根来计算。也就是说,如果三个值为4,5,6μm,几何平均值如下。

几何平均值

注意,算术平均值(当然5μm)是不同的。但是,使用Ppc蛋蛋彩票平台appS,您可以轻松计算pc蛋蛋彩票平台app值几何平均值。因为几何平均值也是pc蛋蛋彩票平台app值日志的算术平均值。

剂量响应曲线为了选择化合物的浓度,请保持这种对数的思考方式。一般趋势是用5:1 nm,5nm,10 nm等操作。但是,因为您是一个专业人员并在日志的土地上工作,所以更好的是几乎是一半的日志。换句话说,1nm,3nm,10nm等。这为您提供了对数剂量响应曲线的更好间距。请参阅下图。这是一种实践,有效地转化为体内试验:1,3和10 mg / kg,而不是1,3和10 mg / kg,可以获得更好的差异。

作为一个例子,看看下面的剧情。这是将数据应用于具有较低= 0,顶部= 100,pc蛋蛋彩票平台app = 100,Hill梯度= 1的pc蛋蛋彩票平台app方程的理论绘图。在左侧的图中,化合物的浓度是线性选择的(1,5,10,50等)。相反,在左绘图中,点是对数选择的(1,3,10,30等)。请注意,点在右侧图中以相等的间隔放置,而左侧的幻灯片则亮起点。产生剂量响应曲线的目的是尽可能多地对许多“剂量空间”进行采样,因此基于对数间隔的剂量,获得更好的采样。哪一个表现出更好的实验计划?哪个绘图是可靠的结果?您想在项目评论中展示哪个?

pc蛋蛋彩票平台app情节

 

 

你不能接受吗?用Ppc蛋蛋彩票平台app替换pc蛋蛋彩票平台app是提高剂量反应的以下五种具体原因。

从pc蛋蛋彩票平台app切换到Ppc蛋蛋彩票平台app改变了数据和实验规划的思考方式。这使得可以考虑对数上关于滴度数据,并且可以停止考虑考虑算术规模。基本上,剂量依赖性抑制是对数现象,因此这样思考是有意义的。

 

1. Ppc蛋蛋彩票平台app鼓励体外测定对数的数据。

考虑绘制pc蛋蛋彩票平台app值的时间。几个系统用于曲线拟合,但所有这些系统都使用pc蛋蛋彩票平台app表达式。但是,如果您查看盖子并查看实际的拟合表达,可以看出,药物浓度的对数实际上用于确定pc蛋蛋彩票平台app值的对数。谢谢。软件可能会为您报告pc蛋蛋彩票平台app,但它将其转换为Log pc蛋蛋彩票平台app。

使用Ppc蛋蛋彩票平台app而不是pc蛋蛋彩票平台app电子实验注意当查看数据时,从微摩拉到纳米多摩拉抑制剂的过渡更平滑,功率值的间隔更相关。

 

2.通过使用Ppc蛋蛋彩票平台app,您可以以易于阅读的方式呈现体外测量数据。

使用Ppc蛋蛋彩票平台app,可以使用两个有效数来覆盖微摩尔和纳米摩尔电位。点之前的一个数字和点后的一位数字,即唯一一个。

什么太棒了?观众现在可以专注于SAR,您可以阻止体操成为精神体操以了解pc蛋蛋彩票平台app值。

 

3.您可以使用Ppc蛋蛋彩票平台app轻松,直观地平均体外测定数据。

今天,让我们说分析的总和是坏事。假设在以下三个重复中测量相同的pc蛋蛋彩票平台app: 1毫米,10毫米,5毫米。计算算术平均值导致平均pc蛋蛋彩票平台app为3.5毫米,但这是不正确的。平均pc蛋蛋彩票平台app数据的正确方法是使用几何平均值,因为它使用指数值。

但是,如果使用Ppc蛋蛋彩票平台app,则您已经输入了对数空间而不计算几何平均值,因此您可以获得Ppc蛋蛋彩票平台app值的算术平均值。 

您可以通过在pc蛋蛋彩票平台app上执行几何平均来以困难的方式执行此操作,并且还可以使用Ppc蛋蛋彩票平台app值算术单元以智能和简单的方式进行。

 

4. Ppc蛋蛋彩票平台app和对数思维将提高开始实验的方式。

在检索试管进行实验之前,使用Ppc蛋蛋彩票平台app是有帮助的。

例如,您是否设置了半十年的稀释曲线,例如1,000,500,100等。逻辑化合物在数据的规模上绘制数据时,您是否注意到数据点凝固而不是相等的间隔?这是因为5的对数标度的1到10之间的一半。 

但是,如果您认为对数步促使您使用Ppc蛋蛋彩票平台app,您会注意到1到10之间的中间数字实际上是3。之后,可以设定稀释液,例如1,000,300,100,30,并且数据点可以清洁,并且可以平滑点间距以沿着曲线落下。这是一个更好的方法来采样密度空间,并从相同的工作中获得更可靠的数据。这不仅适用于体外实验,还适用于体内实验。

 

5.Pic50和对数思维提高了如何查看数据可靠性。

pc蛋蛋彩票平台app测量的可靠性报告复杂。虽然标准误差是众所周知的,但是只要查看数据可靠性并不是另一个一般的方式,但更有用的方式是95%的置信区间,这在这个范围内,它给了我95%的概率。

使用最新的曲线拟合软件,将报告pc蛋蛋彩票平台app的95%置信区间,但您会注意到没有报告标准错误。这是因为算术值(pc蛋蛋彩票平台app)的标准误差没有意义对数数据。这种不正确的方法提供了不正确的结果,例如pc蛋蛋彩票平台app的值是负值。

pc蛋蛋彩票平台app的负值是多少?答案应该喊,因为没有这样的东西。这是日志值开始在算术空间中思考时发生的类型的错误。

 

作为摘要,考虑对数的值是值得的,并考虑Ppc蛋蛋彩票平台app(或PEC50)的值。真的......你可以改变你的生活。

 


此博客由CDD Vault社区的成员编写。 CDD Vault已安全地管理私人和外部生物和化学数据 药物发现信息平台。那是,化学物质注册结构活动提供包含的核心功能。 化学物质的库存管理电子实验注意提供功能!

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