吉姆维基尔,前伊利莉莉,Apex Therapeutics

2011年5月19日

吉姆维基尔爆头

吉姆维基尔是首要化学家 Apex Therapeutics.。吉姆于1971年至2004年为Eli Lilly提供了各种职位,作为一个科学家和研究经理,包括结构和计算科学,发现化学研究 &技术以及高级研究科学家。 Jim是Coalesix Inc.的首席技术官,于2005年在剑桥MA启动公司,直到它于2006年12月成为ICOSYSTEM Inc.的部门。他的经验使他能够理解和翻译化学,生物学和统计数据的学科药用化学家使用预测模型和经验方法优化药物开发分子。彼得来自马歇尔大学的化学化学理学学士学位和有机化学硕士学位。

“我来自南部西弗吉尼亚州南部的西弗吉尼亚州南部,并且人们去大学并不常见…当我退休时,我是莉莉计算化学和结构生物学的负责人。”

采访Barry Bunin,Phd,Ceo,Carborative Discopdy,Inc。

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编辑访谈成绩单

巴里布恩
第一个问题是一个简单的问题,只是告诉我你参与的目前的研究。

吉姆维基尔
与印第安纳大学医学院的医学院的工作专注于新化疗,以治疗儿童癌症,因此我们在那里与生物学家分享一些数据。从历史上看,他们对化学或化学结构并不感兴趣。他们一直在追求基于生物驱动的化合物,并且需要了解该机制,而无需重点关注如何优化这些结构或以任何方式调整它们,这可能使它们更适合其目的。我们正在与他们一起尝试分享该信息,在化学方面教育它们,同时我在这个特定地区教育了生物方面。所以它从那个角度来看。由于我们无法获得内部化学,我们通过合同研究组织进行所有内容,因此它帮助我们跟踪化合物并在内部与我们所做的化合物在内部分享数据,他们所做的那种情况以及生物学测定结果。

巴里布恩
也许谈谈学术–业内合作的行业方面,因为许多研究人员将从行业的角度来看这一点,以及来自学术视角的合作的别人。

吉姆维基尔
当然,基础科学出现在医学院的学术环境中,我们在大学外面占据了大学环境,以推进药物发现和药物优化过程。因此,我们已经创建了一家小公司,并在大学拥有的知识产权周围纺出来。小公司(Apex Therapeutics.)由一些经验丰富的退伍军人组成,来自习惯于运行此护手的大型制药,并在整个过程中了解从步骤a到步骤b所需的内容。我们与我们的学术同行密切合作,培养这些化合物,并使它们在外观和行为中更具吸毒。在小组中代表的Pharma人才的经验是直接应用于来说的学术发现,并在制定新的物质组成方面已经提高了这些资产的价值,使得这些化合物更有效,我们希望,更具选择性,并使它们更适合成为药物候选人。

巴里布恩
如果工作也可以想象,这是什么–也许也可能是更适中的目标,思考两者都总是很好。如果一切顺利,你已经提到了这是儿童癌症的项目,只是谈论从这项研究中旋转公司的灵感。

吉姆维基尔
我们想,当然,他们想参加他们在实验室中的发现,并直接向患者人口应用,他们每天都看到,它们与它们有关,但他们没有知道如何将来自实验室的化合物进入人类,看看他们的想法是否有效。我们想通过在大学环境外面来看,是能够应用额外资源的,也能够完全发展它,意图让它回到大学环境或返回临床环境中我们可以获得理念,并在人类上测试的化合物,实际上,如果它对目标疾病有效。我认为将它脱离的优势是,我们可以将更广泛的画笔施加到问题,因此,带来额外的才能和技能来解决它​​。我们想向这些受响应性的孩子提供一直是非响应的,也是成年人,也是一种额外的治疗形式。当然,我们的终极目标是让这是一个有用的药物,所以这就是我们专注的地方。我认为,在更接近的术语中,我们专注于识别我们想要获得额外数量然后进行测试的候选人 in-vivo.。我们希望获得一些初步的PK数据,以便为美国FDA设置预先居民会面,以讨论进入这种特殊的患者人口的内容,即,获得关于什么样的数据的建议他们希望看到。我想我们正在追踪那样。

巴里布恩
在使用CDD之前,您是如何协作或管理数据的?为什么当时选择CDD?

吉姆维基尔
他们通过Excel电子表格和/或PowerPoint幻灯片传递。我认为,只要你在学术墙内,就可以合理地工作。每个人都有Excel版本,因为它们都是生物学家,一个简单的标识符或共同名称或某种结构上的名字对所有这些都完全良好。但是,当我们参与化学方面时,我们也想在墙外外面,并在一个地理上不同的团体中分享它,那么我们必须做别的事情。传递Excel电子表格给了我们数据,但它有一些挑战,主要是您所拥有的版本的修订日志......您有数据表随身遍地,人们添加,减少事物,制作自己的评论和笔记,所以它必须是一个真正的扭曲捆绑数据。而我发现作为化学家的另一件事是一个真正的问题,是将结构变为Excel。将结构变为一种格式,允许我看到结构但不是在生物学家上的繁琐,他们不关心那张照片是什么。首先,我们将Excel电子表格传递给他们的图片文件。尝试对数据进行排序时存在略有问题。图片总是没有排序。所以我们在Excel中尝试了一些嵌入式插件,一些成功,但仍然不理想。当然,即使使用插件,除非您可以在智能或微笑字符串上执行它,否则您也没有结构搜索功能。我们可以在这些商业数据库中做到这一点; Oracle数据库,数据库的SQL类型,但随后增加了一层复杂性,因为再次,生物学家和许多化学家都没有专业知识,并不真正想要去那里。我们不得不在中间找到一些东西,给了化学家的图形图片,结构搜索能力,但也没有给那种形象造成药理学家和生物学家。和CDD通过并达到目标。这很容易。我们发现它相当易于使用,以及我们地理上不同但能够访问所有的事实,使我们能够以非常少量的培训进入数据库中的实时查看数据。所以这很容易和直观。

巴里布恩
我想在这里搬到更多的个人物品,我认为这将是有趣的。你可以花时间与孙子一起玩,也许不需要做科学只是为了养活自己等等,所以谈论你在你职业生涯的这个阶段以及灵感是什么?是什么让你对你的生活中所做的一切令人引人注目,有趣?

吉姆维基尔
是的,很好,我自2004年以来一直从大制药处退休,我可以诚实地说,我的退休并没有锻炼,或者我认为没有努力,因为我看起来像大多数同事一样在他们所做的事情上,我会得出结论,我会远离科学。而且我的头脑就是这样,即尽管我喜欢我在研究和大制药中所做的事情的事实,那就是好的方式。所以我离开了,转过身来,前往这是思考。结果不是这种情况,因为尽管我的其他兴趣,我发现我被联系人和网络被拉回科学。我有其他爱好。我有孙子,我祝你忙碌了一天,但我总是回到一大部分的科学,在一天的各个小时和各种努力所做的情况下,因为我发现它愉快,很有趣。当我与人们交谈有关在项目上参与其中的时候,底线对我来说,它必须是有趣和有趣的,否则我不会这样做。我对占用另一份工作的这一点,我对这一点不感兴趣,所以我这样做是因为我想这样做,不是因为我必须这样做。我认为这在你看一下任务的方式方面使它​​完全不同,并且一般需要它。我发现我确实花了很少的时间,但如果我出去做别的事情,我不会感到内疚,或者在特定的研究主题每天留下八小时。基本上如果你不必在桌子上放肉而你把它变成一个爱好,那就非常愉快。我不知道我什么时候把它放下。

巴里布恩
所以有些人可能不知道你是一种你在莉莉在职业生涯中扮演的不同角色,而且在没有博士学位的情况下,你上升到了一些责任点,而且很多人认为有一个玻璃天花板,而且你的生活证明不需要,事情可能是一个宗教信仰。所以也许只是谈谈那个关于这个问题的事情,以及从莉莉最终结束的地方的课程,因为我认为这是一个鼓舞人心的故事。

吉姆维基尔
我不知道你想要多少。我会给你整个东西,你可以在显然不想要的任何事情上编辑,因为即使是我在那里的方式是一个有趣的道路。我来自南部西弗吉尼亚州南部的弗吉尼亚州南部弗吉尼亚州,这对人们来说并不是那么常见。我的小型煤镇的主要雇主是煤炭开采和铁路,所以你要么在矿山工作,要在山上挖掘煤炭,或者你在铁路上工作并拖着它。所以这是我的生命。当我去大学时,我在这一点上占据了少数民族,在所有化学中的主要部分,没有人在这个小镇中听过。每个人都认为你上大学,然后作为商人或老师回来。我拿到了化学的学士学位,无法获得工作。 1969年,真正招聘的唯一人是军队。他们试图招募我,我失败了。所以我被困了。没工作。我该怎么办?我继续前进,参加了研究生院几年,认为事情在1971年的事情会更好。他们有点好。我申请,它似乎是数百人的制药公司。当我在研究生院,做了我的论文研究时,其中一位教授指出了这位特定行业的方向。所以当我申请时,我得到了数百个拒绝。只有一次面试提议,在 伊利莉莉& Company,我走到这里,采访了,并得到了报价。所以我说那很好,我要去上班了。我没有得到一份工作,备份计划是要再去研究生学校。我去的地方有一个终端硕士学位,所以我还在化学的其他研究生院申请,如莉莉的计划,我曾担任实验室大鼠,并学习了医药化学。我有一位伟大的老师在那里允许一些灵活性和自由学习和成长,这并不总是发生。我回头看,我非常幸运能与这个人联系。慢慢地随着时间的推移,我长大了队伍,并最终得到了自己的高级责任实验室。在Lilly在Lilly的35年中大约一半作为药用化学家。在80年代的某个地方 MDL. 来自现场,电脑的力量进来了,我开始对电脑感兴趣。当然,我们的一代人,我们从未暴露过计算机技术。但我对电脑的力量感兴趣,以及它可能适用于化学。我一直在发展一个有趣的 QSAR.,那么排序的定性感应,因为你没有做任何令人毛骨数学计算或计算今天所谓的任何属性或任何东西。它基本上是Dreed模式和一张纸和一支铅笔。所以我对MDL软件感兴趣,开始涉及抄袭,实际上写小程序。我在那些日子和DCL,DEC命令语言中攻击了一点Fortran,并开始将事物从MACCS中取出并重新洗牌,并将它们放回MACCS软件并显示它们。我学会了这样的伎俩,开始采取工具,使其对实验室科学更有用。当莉莉获得了一个时,最终导致了机会 CRAY超级计算机大约1989年,创造了一个计算化学组。我离开了实验室并加入了当时,我认为可能是三位物理化学家,一个晶体和我自己。该群体在一段时间内增长,最终达到了我职业生涯结束的地步,我是计算化学组的负责人。当时,大约有20个计算化学家,我在我的小组中拥有的另外十个晶形运动员,我对这些人负有责任和责任,其中大多数是博士。所以当我离开时,当我退休时,我是莉莉计算化学和结构生物学的主管,对我来说这是一个很好的职业生涯。我回头看,沿途很有趣。我学到了很多东西,继续学习很多,我不认为我会改变一件事。

巴里布恩
好的。那好极了。

吉姆维基尔
那是你听到的故事吗?

巴里布恩
那是......好吧,这是我第一次听到这样的细节,如此美妙地听到。我认为这是一个伟大的故事。我对科学观众有了一个相关的问题,显然是没有披露任何机密的,但也许你可以分享一种‘aha’在药物发现或科学的时刻,发生的事情,即在上面和超越日常的实验和一个激动人心的时刻。它可能在高校或行业或任何地方–如果你有什么要分享的。这是我的最后一个问题。

吉姆维基尔
我认为研究充满了那些‘aha’时刻,我当然,正如我反映的那样,有了我的份额。我有机会在一些早期的过程中工作,作为化学家,提出一个最终成为莉莉农业部门的销售药物的化合物的制造过程。制定化学提供了许多‘aha’那边的时刻。我还在一个项目上工作,尺寸和持续时间是闻所未闻的这些日子,但我们在反病毒中的研究项目和大部分大约十年来,我是该项目的唯一化学家。在十年的过程中,几个人来了,随着强度加热,并且发现升温,但它是所有预分子生物学,所以事情越来越慢,而且化学当然,开始了来自空气,火灾和水,一切都花了很长时间才能做到。但最终,我们最终将两种化合物放入诊所进入人类,这是非常有益的。在人类的背景下,我们有一个申请人一次通过莉莉来了一次,他正在作为化学家进行面试,并且事实证明,他......好吧,让我稍微回到一点点。临床试验,人类试验,在这种情况下,普通感冒, rhinovirus.,被给予受感染的患者。你可以给人类给那种疾病。因此,通常,这些中心的一些人将至少在那个时候服用校园内的学生在春假期间脱离校园,并用rhinovirus感染其中一些,其中一些人会得到安慰剂,然后我们会对这对夫妇进行治疗两组几周,只测量流鼻涕和出现的病毒滴度。通过采访的人之一出现在大学,为这些研究中的一个进行了自愿。我们有一个很好的故事,告诉和交换关于我们是否认为他收到药物或安慰剂的笔记。我仍然不知道这一天的答案。但这对我的职业生涯来说是一个很好的个人评论,因为我与整个事情有关。我猜从一个计算意义,在那些早期的Cray-2工作,并拥有所有的‘aha’花了前克雷片的时刻,12到24小时做一个 马皮克 计算,然后突然拥有一个克拉-2,几分钟就具有相同的计算,是一个真实的‘aha’来自技术的立场。我只是认为我在40年来见过很多东西。我已经看到了很多技术和许多事业的变化。我认为最近的一个‘aha’我见证的时刻是,我在不到20年的那些药用的化学家中反映了我的职业生涯,也许是赚了1,000个化合物,今天,这只是一个人在实验室中可以做些什么。所以我告诉人们的差异是回来的–回到那些日子里,我们最终挤到了一大克,这只是最小的数量来获得很多 in-vivo. 测定和完成的广泛筛选,所以它是一个不同的球形。

巴里布恩
我认为这是一个美丽的便条,最终结束,并感谢您在面试中的时间。

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