CDD保险库更新:计算和模型

CDD保管库更新标识
2014年5月10日

我们介绍 CDD Vision.,新的分析和可视化产品,CDD保险库中的预测模型建筑,以及较小的较小增强功能。我们很高兴看到您在此版本中的工具可以实现的内容。

协议内的计算 - CDD视觉的一部分

这是CDD Vision的介绍性释放,为CDD Vault的可选扩展名。当在Vault中启用CDD愿景时,可以对协议读数,化学特性和数字常量执行自定义计算。后来的版本将为决策支持带来动态可视化套件。立即开始使用CDD Vision,联系 [电子邮件 protected] 对于早期的采用计划。

计算被定义为协议内的新类型的读出定义。

add_calculd_readout_definition.

此版本允许您在计算中使用化学特性和读数在计算中的单个协议中。即将推出的版本将允许您将读数定义与一个计算中的单独测定组合。

example_formula

交互式公式生成器使其易于定义计算,并且应该对Excel用户感到熟悉。最好的部分是,一旦创建,将在将新数据导入协议时自动更新计算结果,或者由于编辑结构而发生化学性质。 阅读计算教程.

模型建设者 - CDD Vision的一部分

这也是CDD模型的介绍性发布,该模型包括在您的CDD视觉订阅中。请联系 [电子邮件 protected] 学习如何开始使用它。

仅创建型号只需要您选择使用作为培训集的测定并选择活动化合物。贝叶斯统计模型是使用结构的FCFP6指纹构建的,然后用于对您尚未筛选的化合物进行排名。

该模型存储为一种协议,并提供ROC PLOT,以便您可以衡量其有效性。

鹏

该模型将在创建时自动将所有化合物分批到您选择的项目中。您可以随后与其他项目分享以获得其他分子。每个分子接收相对得分,适用性度量和最大相似度。

model_readout_definitions.

值得指出的是,最大相似值是独立于贝叶斯模型的,并为您提供了一次使用所有活动化合物执行相似性搜索的方法。

模型功能非常符合Beta,并且在来年将在显着发展。我们’d 喜欢听到 您希望使用模型进行的内容,帮助指导进化。 阅读CDD模型教程.

其他值得注意的变化

出口板图

准备樱桃摘或稀释板时,可以轻松下载母体复合板贴图,直接从“板”标签。只需搜索板名称,然后点击导出板映射。导出的文件包含板和井位置,分子和批量分配。

export_plate_map.

多个文件附件

对于消息,分子,板,运行,引用和协议,可以通过使用计算机的文件管理器应用程序(Windows上的Proforer在Mac上的Finder上的资源管理器)中选择多个文件,从一步中上传多个文件。所有附件的图像也呈现为上传后的预览。

打印友好情节

通过在导出到Excel时选择“单色”选项,可以将剂量响应图印刷为单色(灰度)图像。

Export_plot1.

Export_plot2.

更新剂量响应计算

剂量响应计算不再需要在交叉点上方的活动点。例如,当没有响应超过50%时仍然可以报告IC50。

更新API接听电话

除了其他分子属性和结构格式之外,GET分子现在还返回IUPAC和INCHI结构。

PKA类型

CDD报告最强的酸性或基本PKA值。我们已添加一个字段以指示计算的PKA值是否适用于酸性或基本中心。

PKA.