CDD在UCLA的实施 - CMCR

2011年10月5日

在这个客观的博客中,Andrew Norris博士描述了UCLA如何 - 对辐射的医疗对策(CMCR)实施了CDD。

主要目标 UCLA CMCR. 是对新型小分子药物引线的发现和开发,作为辐射分子,除了推进我们对人类的辐射毒性和致死性的理解之外。

CDD对我们的计划一直非常重要,并在UCLA辐射保护筛查核心中实施,作为该努力的一部分。在该核心内(图1),基于表型和基于目标的屏幕结果被输入CDD数据库,将生物结果连接到化学结构。为诸如结构活动关系,子结构分析和其他可以在UCLA程序内部或外部的确定信息进行开采数据。然后合成彻底测试的化学实体(引线),然后通过蛋白质组学,化学信息学和模拟综合进一步探索这一点,作为支持筛选信息管理的平台以及作用机制的发现。在动物中测试了多种铅候选者。此数据均编译回数据库。多年来,与化合物相关的数据的宽度已成为显着,并且已经产生了几种成功的铅分子。

CDD在UCLA CMCR

图1:UCLA-CMCR筛选计划的整体战略方法的原理图。 CDD在努力中涉及的团体的存储,管理,处理和社交网络中扮演一个组成部分。

我们发现特别有用的CDD平台是,我们能够从完全不同的位置和学科网络网络网络,其中小分子是它们之间的共同语言。该软件的另一个有用方面是数据库用于区分分析的小分子的哪些方面最有效或负责从电离辐射中减轻细胞损伤/死亡。这是我们SAR研究的关键方面,也是为了在我们的数据中排除错误的否定。

此外,该平台允许进入包含所需特性槽商业和私人来源的新颖结构,该数据库是灵活的,包括几乎所有类型的生物数据输入,与被检查的小分子相关联。迄今为止,来自不同背景的15个研究组通过数据库联网,已经研究了超过100,000种化合物进行活动。


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