公开可用的最重要pc蛋蛋彩票平台app是什么?如何使用它?

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2018年10月22日
为什么公开的pc蛋蛋彩票平台app重要?合作药物发现(CDD),eln

开源pc蛋蛋彩票平台app和药物发现的未来

比尔和梅琳达盖茨基金会开放式访问集团阿什利 恶魔岛基于讨论,Embl-Ebi 安德烈富裕, [Chembl]提供者, 在NIH MCBI / NLM Evan Bolton, Pubchem的提供商,CDD和弗兰克电话。

这是第二系列对开源pc蛋蛋彩票平台app和药物发现的影响的第1部分。第2部分, 开源pc蛋蛋彩票平台app的未来必须持有什么药物发现?

增加增加分享药物发现信息的金额和质量的兴趣。

更多开放式访问pc蛋蛋彩票平台app有助于在整个药物发现过程中的研究人员,并有助于防止“重新创建轮子”,并专注于左疾病。

2006年,CDD在私人CDD螺栓上介绍了一部公开款。

CDD平台有超过250万个想要分享和发布pc蛋蛋彩票平台app的化合物和相关pc蛋蛋彩票平台app。 CDD网站有一个公共访问部分,可以使用保险库的公共部分。

可以在CDD公共pc蛋蛋彩票平台app中使用的结构也可以在Pubchem中使用,并显示CDD公共生物识别pc蛋蛋彩票平台app的链接。 CDD继续添加并扩展CDD保管库中存在的公开pc蛋蛋彩票平台app。

社会的大开源pc蛋蛋彩票平台app库的价值是一个庞大和科学的社区,我们继续提高这些pc蛋蛋彩票平台app库的地位。

用于化学和生物pc蛋蛋彩票平台app的大型和高度选择的化学pc蛋蛋彩票平台app库和大规模的Pubchem存储库是研究人员可以访问的公共药物发现pc蛋蛋彩票平台app库的两个例子。

达到可以使用所有竞争性药物发现信息来获取公民科学家或大型新药物开发公司的这些信息将会更好。

填补更加开放,可访问信息的最终目标,重要的是优化可以访问pc蛋蛋彩票平台app的系统和人类的系统。

在化学信息学杂志中如图所示,开放pc蛋蛋彩票平台app最重要的即时赞助商是一种化学算法,可以在不通过现有的发布方法无法实现的规模上吸收和展示在工作化学家上的简洁洞察力。

但是,为了获得这些数字化学算法的好处,可以快速综合和建议pc蛋蛋彩票平台app洞察力,您需要将范例转换为单个科学家如何将pc蛋蛋彩票平台app转换为数字格式。

大多数科学家目前以设计用于演示的方式进入pc蛋蛋彩票平台app,而不是机器学习算法的消费。科学家需要额外的文本和数字票据来通过算法消耗此pc蛋蛋彩票平台app,但完成此套件所需的额外努力是投入科学家的摘要。

CDD宣布此问题的一个解决方案是简化的用户界面,该用户界面被设计为一种混合系统和科学家,这些系统和科学家们将基于自然语言处理组合的机器学习,科学家可以以最少的努力策划pc蛋蛋彩票平台app。

删除科学家的障碍以通过pc蛋蛋彩票平台app算法解释pc蛋蛋彩票平台app的方式记录pc蛋蛋彩票平台app是创建全球科学家可以访问的大型开放可搜索pc蛋蛋彩票平台app库的第一步。

作为一个社会,捕捉所有生物学并继续确保它会非常有帮助,不要重新创建或反复,不要重新创建或反复。

在这里,研究人员描述了可以找到的信息类型,这些信息可以与最可用的pc蛋蛋彩票平台app库以及如何使用ChemBl和Pubchem一样多。

  • CDD BOLT ELN博客帖子"1" 목록 아이콘

    "轮子娱乐"하지 않는다는 것을 알 수 있도록 방대한 정보 자료에 대한 액세스

    PUBEM. 它是最着名的档案,但它也是一个知识库。

    Pubchem将帮助研究人员与化学信息以及特异性化合物的已知生物活性。

    Pubchem的pc蛋蛋彩票平台app将与研究人员的全系列系列集成:基因,基因组和文献,以及毒性等物理性质。

    可以通过Pubchem检索文件的生物pc蛋蛋彩票平台app,基本化学pc蛋蛋彩票平台app和巨大的化学品。

    ChemBl是手动产生的生物相容性分子pc蛋蛋彩票平台app库。

    其中大多数与药物发现有关,这是许多pc蛋蛋彩票平台app起源的地方。

    然而,存在不同类型的生理活性,包括小分子,肽和治疗抗体。

    ChemBL具有一定的定制策策,可提高pc蛋蛋彩票平台app库中的信息质量。

    ChemBl还共享pc蛋蛋彩票平台app和pc蛋蛋彩票平台app,如Pubchem。

    pc蛋蛋彩票平台app共享和可访问性是关键。

    否则,研究人员将能够重新创建轮子,而不是以快速方式和浪费时间找到更多的发现。

  • CDD BOLT ELN博客帖子"2" 목록 아이콘

    搜索特定生物目标的pc蛋蛋彩票平台app,以查找问题的答案

    Chembl. 包括分子的pc蛋蛋彩票平台app及其用于生物靶标的活动。

    因此,在Chemblpc蛋蛋彩票平台app库中,“这种特殊的蛋白质,或显示您拥有的所有生理活性分子,实际上,”你可以提出问题“

    然后,使用在出版物和文档中报告该蛋白质的pc蛋蛋彩票平台app,ChemBl显示所要求的信息。  

    它可以要求关于分子的后续问题。

    “目标是什么选择?这个分子的状况是什么?它们是否在临床试验?他们出售毒品?”

    在Pubchem,研究人员可以使用pc蛋蛋彩票平台app视图来收集有关生物目标的信息。

    如果研究员对特定目标感兴趣,您不需要看到数千个不同的实验。

    相反,当您使用Data View时,所有内容都有一个单个页面,该页面与一个文档聚合。

    它将能够运行更多。

    您还可以使用基于聚合器的页面使用基于聚合的页面查看目标集,而不是查看尽可能多的对象。

    例如,研究人员可能对单个GCPR感兴趣,而不是对所有GCPRS或单个钾离子通道受体感兴趣,而是所有钾离子通道受体。

    聚合页面允许您提出这些广泛的问题。  

    这允许研究人员访问和下载所需的内容,然后在自己的研究中执行更多任务。

  • CDD BOLT ELN博客帖子"3" 목록 아이콘

    在一个地方搜索大量分子和子结构

    除了搜索这些大型pc蛋蛋彩票平台app库的生物目标,还可以执行分子查询。

    例如 ChemBl可以搜索特定的兴趣复合或基于子结构的查询。

    当确认感兴趣的化合物时,研究人员可以搜索他们想要的其他生物识别pc蛋蛋彩票平台app或其他信息。

    核心是一切都集成到此核心资源中。

    在Pubchem,在系统内部集成了大约9500万小分子化学物质,其中约有3000万化学品有一些笔记。

    当您在Pubchem中搜索分子时,pc蛋蛋彩票平台app库与各种不同的知识库集成,其几乎所有关于特定化学品的一切都总结道。

    Pubchem有600多个目录参与者。

    Pubchem专注于将所有pc蛋蛋彩票平台app放在一个地方,以查看可以在一个地方使用的信息而不是导航数十个其他站点。

    此外,如果他们对完全识别和获取更多信息,研究人员可以重新连接到另一个网站。

  • 概括

    如何通过开放pc蛋蛋彩票平台app使用这些高性能工具和大型pc蛋蛋彩票平台app库来应对问题的点如何达到一个点?这是一个到达这一点的工作,并且有许多难题和当前的障碍,我们必须通过我们未来的在这一领域的成功。这是我们这种药物发现创新和快速的目标之一。但是,重要的是要继续促进新的药物发现pc蛋蛋彩票平台app以更广泛使用。

此博客创建CDD Vault社区的成员。 CDD Vault主持全部个人和外部生物和化学pc蛋蛋彩票平台app安全管理 药物发现信息 平台。 化学登记, 结构活动, 化学品库存, 电子包装笔记本 기능 등 핵심 기능을 제공한다.

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