什么是pic50?

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2018年7月31日
什么是pic50?对效力的对数思考导致结果的更好概念化。合作药物发现eln。

什么是pic50?简单地说,PIC50是在转换为摩尔时IC50值的负日志。

例如,一个 IC50 1 um为1 x10 ^ -6 m,这等于6的pic50。

纳米摩尔化合物的IC50为1×10 ^-9μm,是950的950。

使用PIC50鼓励处理依赖依赖关系所需的对数思维。

但是,如果这是您始终完成的那样,为什么会停止使用IC50值?

为什么要制作开关?

因为效力值的性质是对数的,所以你将如何报告您的数据应该是基于日志的。

如果您查看剂量 - 响应曲线,当您在对数空间中绘制时,它们是符合矩形的。

使用PIC50是思考数据的正确方法。

如果你的效力下降,因为你已经从微摩拉到纳摩尔,那是一个指数变化,而不是线性变化。

PIC50真的是考虑化合物效力的正确方法,这就是为什么人们一直使用对数规模用于复合浓度的年龄。

3种类别,帮助您对对数进行思考并提高您对PIC50的理解

但是,在切换到PIC50时,肯定会有一个过渡时间。

这就像从皇家测量系统到公制测量系统。
起初是有点痛苦的,但它值得做。

最终,PIC50将变得直观,因为人类实际上非常自然地认为更大的数字更好。

为了帮助转变更容易,想到您已经遇到的其他常见对数性情况有助于您可以鼓励采用对数思维。

  • "1"CDD Vault eln博客帖子的列表图标

    里希特比例

    关于PIC50的思考类似于思考Richter Scale(图为)

    来自Wikimedia Commons的JKWCHUI [CC BY-SA 3.0]通过修改

    Richter Scale是报告地震幅度的对数方法,这意味着振动的10倍增加是Richter秤的1倍。

    考虑PIC50作为药物发现的Richter规模可能有用,因为在地震方面的重要性在化合物的效力方面也显着.

    对于试图从IC50调整到PIC50的人来说,它起初可能有点尴尬。

    例如,许多人没有感受到3.0的Richter Scale Artrquake。

    没有伤害。

    同样,在PIC50方面写回家并不多。

    3.0的PIC50是毫米化合物.

    在6.0时,事情开始变得更有趣。

    随着6.0地震,您将开始对人口稠密地区进行一些适度造成的伤害,并且一张6.0 PIC50将开始让您的化学家兴奋,因为现在您正在进入微摩尔化合物。

    当你走高时,你就会变得更好,更好的效力 - 或越来越损害地震。

    一旦你达到9.0,那就是你想要的地震。这是史诗般的破坏。

    但是,3.0的PIC50 - 这是你想要从你的化学家获得的抑制剂中看到的那种效力。

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    pH级别

    pH值的形象是伐木表演的例子

    来自Wikimedia Commons的Hans Kirkendoll [CC0]的图像

    思维对数不是似乎外国。

    这实际上是你多年来一直在做的事情,因为你敲了高中毕业的气瓶。

    自从你第一次遇到pH级别以来。

    因为 pH是氢离子浓度的负日志 磨牙。

    在思考pH时,您不会考虑微摩尔或毫米水平的氢离子浓度。

    你已经习惯了这个。你认为他们只是作为pH值。

    你一直在思考。

    您可以使用对数思维不仅仅是为了pH,还可以使用 使用PIC50的IC50或效力数据PIC50只是IC50IN摩尔的负日志。

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    家庭清洁剂的效力。

    对数思维甚至可以在家里开始。

    想想你的厨房或浴室清洁剂。

    标签可能说,“杀死99.9%的病毒和细菌”。

    那么,这是什么意思?

    这是否意味着,如果我买了一个不同的更清洁剂,它会杀死99.99%而不是99.9%,那么它只会更好地是.09%?

    或者,为了更明显地捕捉概念,如果抗菌杀死99.9%,我可以把它放在两次杀死199.8%吗?

    虽然这些都是悲观和愚蠢的问题,但他们都认为,虽然存在算术宇宙中的指数数据存在谬误这一事实。

    在抗感染圈中,杀死99.9%的杀戮实际上被称为三个日志杀戮。

    这是为什么?

    如果某些东西杀死90%的传染性生物,这意味着传染性生物计数降低了10倍,通常被称为一个日志杀死或一个数量级。

    99%的杀戮是减少100倍,造成99.9%的杀戮是1,000倍的减少 - 你得到了GIST。

  • 概括

    认识到算术设置内思考这种常见对数测量的荒谬性质将有助于您在讨论效力值时实现使用非对数方程的谬误。有关此主题的更详细讨论,请观看此主题 Marc Navre博士的介绍 并了解为什么 使用PIC50而不是IC50会改变你的生活.

此博客由CDD Vault社区成员创作。 CDD Vault是一个托管的 药物发现信息学 安全地管理私人和外部生物和化学数据的平台。它提供核心功能,包括 化学注册结构活动关系化学库存, 和 电子实验室笔记本 capabilities.

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