CDD授予150万美元的授予自动化开源机器学习模型

2017年4月25日

加利福尼亚州伯灵县 - 2017年3月27日 - CDDVault®Web的药物发现信息平台的合作药物发现,宣布他们已被授予1.5M阶段2B SBIR Grant,以自动化标题为“跨分布式私人的生物动力的机器学习模式pc蛋蛋彩票平台app集以增强药物发现。“

这项工作建立在两个 早期的项目 提供开源描述符和1单击CDD Vault中的模型构建,并在CDK开源工具包中用于任何软件。重要的是,描述符和算法在CDD和PFizer之间的共同发布中验证了大量不同pc蛋蛋彩票平台app。 “使用开源计算工具来预测人类代谢稳定性和额外的ADME / TOX属性”(参见:Gupta,R. 药物代谢DIMPOS,38:2083-2090,2010).

ECFP图

此SBIR Grant将为流行的CDD Vault平台中提供更协作,差异化的安全共享的方式。 “这个项目的令人兴奋的,雄心勃勃的一部分是通过对模型选择的自动优化来实现民主模式,这比个人专家驱动的模型建设的成本更有价值。这在我们的曲目记录上建立了同样复杂的生物测定pc蛋蛋彩票平台app捕获更多地参与一系列异质科学家。“ Barry A. Bunin,Phd,CDD首席执行官和主体调查员(PI)在这个最新的补助金。

奖励编号的具体目标2R44TR000942-05:

我们的目标是民主化在历史上限于计算专家的药物发现中的作用 - 并允许模型成为学术界,基金会,政府实验室和没有拥有的小公司的常规辅助今天雇用他们的资源。在第2阶段,我们直接在CDD的基于Web的CDD Vault平台内实现了修改的贝叶斯模型建筑,其安全地托管了结构 - 活动关系(SAR)pc蛋蛋彩票平台app;任何用户现在都可以轻松地使用存储在私人万库中的实验pc蛋蛋彩票平台app培训贝叶斯模型,然后应用模型以预测未经测试的化合物的活动。在第2阶段,我们建议通过以下新的特定目标概括这一能力,这是实现广泛的科学和商业影响所需要的:

Aim 1: 集成了一套多样化的计算技术(例如QSAR,神经网络,支持向量机,随机林,K-CORLED邻居,并且可能其他人)进入单个框架,以允许直接并排进行比较。

Aim 2: 开发和验证一个通用的度量标准,该标准将应用于特定pc蛋蛋彩票平台app集的每种方法的预测强度等级。

Aim 3: 将度量标准应用于从高质量,公共访问结构 - 活动和ADME / TOXpc蛋蛋彩票平台app集的数千个模型,并向用户提供键结果。

Aim 4: 通过聚合多个pc蛋蛋彩票平台app集,开发一种新颖的建立模型,并通过聚合多个pc蛋蛋彩票平台app集来共享模型,而不会在训练集中显示化合物和pc蛋蛋彩票平台app。

协作药物发现(CDD)建议开发技术,以大大简化和整合利用预测模型用于药物发现所需的所有流程。该软件将使科学家轻松,无需在信息学中的专业培训,以更少的努力创建,列车,申请,评估,分享和归档模型,并且还利用大型预先计算模型的零效率。该软件还将使科学家能够在不同组织中工作,以共同构建模型从其聚合的pc蛋蛋彩票平台app和彼此共享这些模型,而无需共享底层培训pc蛋蛋彩票平台app。

关于这一补助金

2B阶段小型企业创新研究(SBIR)是能够共享生物pc蛋蛋彩票平台app的计划的一部分。 奖励国家中心2R44TR000942-05(如上所述)推进翻译科学中心 NIH记者 支持这个项目。内容完全是作者的责任,并不一定代表官方意见 国家推进翻译科学中心 或国家健康研究院。

关于合作药物发现,Inc。

CDD(www.collaborativedRug.com.)旗舰产品“CDDVault®”,用于管理化学登记,结构活动关系(SAR)和安全规模合作。 CDDVault®是一个托管pc蛋蛋彩票平台app库解决方案,可靠管理和分享生物和化学pc蛋蛋彩票平台app。它让您直观地组织化学结构和生物学研究pc蛋蛋彩票平台app,并通过易于使用的Web界面与内部或外部合作伙伴合作。 CDD Vault中的可用模块包括活动和注册,可视化,库存和eln。

A complete list of >60 publications and patents from CDD can be found online on our resources page: //www.selacapo.net/pages/resources.

媒体联系方式:Barry Bunin,PHD,协同药物发现,(650)204-3084, [电子邮件 protected].