CDD Vault与Sarvision集成| SM.

CDD Vault更新标志
August 15, 2018

SARvision|SM and CDD Vault

SARVIONION | SM具有与CDD Vault连接的功能,并导入存储在Vault中的数据,以便于结构性分析(或SARVision的序列结构分析)。 SAM允许您自动识别趋化型,在分层树中围绕脚手架进行分子,创建易于r-group表,网格视图,执行匹配分子对分析,枚举图书馆,可视化与化学物质相关的图表,可视化数据,过滤器表通过所选属性范围,一次搜索具有多个查询的库,与Word和Excel为您的报告无缝连接。 Amedeo是一个add-on to SARVision | SM,为使用机器学习提供了用于铅优化的工具。

一些简单的步骤显示如何访问CDD Vault帐户,然后将与您的分析相关的数据拉到Sarvision | SM

1)登录CDD保险库并转到 Settings. Under API Keys | Add a new Key 与sarvision一起使用。复制此密钥,以便在下一步中可以将其粘贴到sarvision中。此键包含允许SARVISION的所有信息才能访问您CDD Vault数据库。请注意,可以删除它以在以后删除访问。

1 CDD Settings

2) In SARvision|SM, under File->Import from->CDD Vault… 粘贴在步骤1中复制到正确的框中复制的API令牌,如图所示。更新按钮将重新加载可以访问的CDD Vault中的可用保存查询。如果您没有任何,请登录CDD保管库并创建一些。在ChemApps CDD Vault连接器中,选择一个查询并按 Import button.

3)加载了一些数据后,右键单击“数据表”选项卡并使用 Columns… 控制清理表格并仅显示相关列。

4)右键单击脚手架树工作区(左上角)以获取树菜单。选择 Identify scaffolds… 并使用默认设置生成表示该特定数据集的相关化学核心或脚手架。

5)用户可以通过右键单击该脚手架和选择来编辑树中的任何脚手架 Edit scaffold… 用户还可以拖放脚手架,删除脚手架并使用此菜单手动在脚手架中绘制。

6)可以添加数据的其他视图 main menu->Insert。在此示例中,添加了R组表。要触发表的重建,请双击任何脚手架。这将加载属于该支架的分子,相对于支架和颜色码基于支架的分子重新定位它们。

现在您可以访问大量的用于小分子药物发现中的铅优化,图书馆设计或其他任务的工具。

这为您打开了许多选项来分析数据......

Grid Views:

RxR Tables:

Matched Molecular Pairs:

几种绘图选项,包括脚手架图:

并添加机器学习的力量,以便使用Amedeo提供活动或Adme相关属性的优化。

CDD Vault还与SARVISIONICS无缝连接,该程序也为进入和组织生物聚合物组织数据的平台。该程序可以被视为智能电子表格,简化了肽,蛋白质,核酸的生物聚合物的工作,化学改性残基和非天然氨基酸。 SARVISION |生物制剂提供了许多工具来与活动相关的顺序。

Altoris,Sarvision的制造商| SM发布了一个 short video 在您的管上,显示集成蜂箱CDD拱顶和SARS的步骤。

 

As always, feel free to contact CDD Support for assistance.